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Rank | Bacteria | BiomeSight 2450 Samples |
Thryve 1538 Samples |
uBiome 792 Samples |
custom 67 Samples |
BiomeSightRdp 41 Samples |
CosmosId 37 Samples |
SequentiaBiotech 36 Samples |
Thorne 35 Samples |
es-xenogene 35 Samples |
Microba 29 Samples |
AmericanGut 18 Samples |
Medivere 7 Samples |
Microba1 3 Samples |
GanzimmunDiag 3 Samples |
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biotype | Haemophilus influenzae aegyptius | 1 | |||||||||||||
biotype | Mycobacterium tuberculosis variant caprae | 1 | |||||||||||||
biotype | Mycobacterium tuberculosis variant pinnipedii | 231 | |||||||||||||
clade | 50 kb inversion clade | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
clade | Alveolata | 4 | 1 | ||||||||||||
clade | Amniota | 1 | 20 | 11 | |||||||||||
clade | Amoebozoa | 1 | |||||||||||||
clade | ant endosymbionts | 593 | 2 | 11 | 4 | 6 | |||||||||
clade | ant, tsetse, mealybug, aphid, etc. endosymbionts | 608 | 1 | 2 | 11 | 4 | 6 | ||||||||
clade | aphid secondary symbionts | 26 | 1 | 1 | |||||||||||
clade | Archamoebae | 1 | |||||||||||||
clade | Archelosauria | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Archosauria | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Asgard group | 1 | |||||||||||||
clade | asterids | 18 | 25 | ||||||||||||
clade | Bacillariophycidae | 1 | |||||||||||||
clade | Bacteria candidate phyla | 200 | 3 | 5 | 35 | 3 | |||||||||
clade | Bacteroidetes/Chlorobi group | 2450 | 1538 | 790 | 65 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
clade | Bilateria | 695 | 8 | 11 | 1 | 25 | 1 | 8 | 5 | 1 | |||||
clade | Blastocystis sp. subtypes | 1 | |||||||||||||
clade | Boreoeutheria | 1 | 18 | 1 | |||||||||||
clade | Caldiserica/Cryosericota group | 2 | 13 | 7 | 1 | ||||||||||
clade | campanulids | 25 | |||||||||||||
clade | candidate division Obsidian Pool 11 | 6 | |||||||||||||
clade | Candidatus Baumannia | 3 | 1 | ||||||||||||
clade | Candidatus Dependentiae | 7 | 3 | ||||||||||||
clade | Candidatus Peribacteraceae Anantharaman et al. 2016 | 7 | |||||||||||||
clade | Candidatus Uzinura | 1 | |||||||||||||
clade | Centramoebida | 1 | |||||||||||||
clade | Coelurosauria | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | core chlorophytes | 1 | 1 | ||||||||||||
clade | core genistoids | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
clade | CRuMs | 1 | |||||||||||||
clade | CS clade | 1 | |||||||||||||
clade | CUG-Ser1 clade | 1 | |||||||||||||
clade | Cyanobacteria/Melainabacteria group | 2314 | 1083 | 32 | 7 | 27 | 18 | 35 | 5 | 1 | 7 | 7 | 3 | ||
clade | Deuterostomia | 5 | 1 | 25 | 8 | 1 | |||||||||
clade | Dicondylia | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 4 | 1 | |||||||
clade | Dictyostelia | 1 | |||||||||||||
clade | Dinosauria | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Dipnotetrapodomorpha | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
clade | Discoba | 1 | |||||||||||||
clade | Ditrysia | 23 | |||||||||||||
clade | dothideomyceta | 1 | 1 | ||||||||||||
clade | DPANN group | 1 | |||||||||||||
clade | Duplodnaviria | 1 | 6 | ||||||||||||
clade | Ecdysozoa | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 5 | 1 | |||||||
clade | Elliptochloris clade | 1 | |||||||||||||
clade | Embryophyta | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | eudicotyledons | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Eumetazoa | 719 | 8 | 11 | 1 | 17 | 1 | 8 | 5 | 1 | |||||
clade | Euphyllophyta | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Euteleostomi | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
clade | Eutheria | 1 | 18 | 1 | |||||||||||
clade | fabids | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
clade | FCB group | 2450 | 1538 | 790 | 65 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 29 | 18 | 7 | 3 | 3 |
clade | genistoids sensu lato | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
clade | Gnathostomata | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
clade | Gunneridae | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Haptista | 1 | |||||||||||||
clade | Heliantheae alliance | 25 | |||||||||||||
clade | lamiids | 18 | |||||||||||||
clade | leotiomyceta | 9 | 1 | 1 | |||||||||||
clade | lice endosymbionts | 1 | |||||||||||||
clade | Lophotrochozoa | 439 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||
clade | Luna-1 subcluster | 3 | 5 | 1 | 22 | 3 | |||||||||
clade | Mandibulata | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 4 | 1 | |||||||
clade | mealybug secondary endosymbionts | 1 | |||||||||||||
clade | Mesangiospermae | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Metamonada | 1 | 1 | ||||||||||||
clade | Methanomada group | 619 | 332 | 220 | 32 | 21 | 7 | 16 | 25 | 4 | 11 | 7 | 3 | 3 | |
clade | Monodnaviria | 25 | 6 | 7 | |||||||||||
clade | Nitrospinae/Tectomicrobia group | 11 | 7 | ||||||||||||
clade | Obtectomera | 23 | |||||||||||||
clade | OCC clade | 1 | |||||||||||||
clade | Ochrophyta | 1 | |||||||||||||
clade | OM182 clade | 1 | |||||||||||||
clade | OMG group | 1 | |||||||||||||
clade | Opalozoa | 1 | |||||||||||||
clade | Opisthokonta | 719 | 8 | 11 | 13 | 17 | 1 | 27 | 13 | 13 | 6 | ||||
clade | OUU clade | 1 | |||||||||||||
clade | Panarthropoda | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 4 | 1 | |||||||
clade | Pancrustacea | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 4 | 1 | |||||||
clade | Patescibacteria group | 6 | 1 | ||||||||||||
clade | Pentapetalae | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Protostomia | 690 | 8 | 11 | 25 | 1 | 5 | 1 | |||||||
clade | Prymnesiophyceae | 1 | |||||||||||||
clade | PVC group | 2271 | 1366 | 570 | 29 | 32 | 22 | 29 | 35 | 34 | 12 | 14 | 5 | 2 | 3 |
clade | PX clade | 1 | |||||||||||||
clade | Rhizaria | 2 | 2 | 1 | |||||||||||
clade | Riboviria | 1 | |||||||||||||
clade | rosids | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
clade | saccharomyceta | 13 | 27 | 9 | 6 | ||||||||||
clade | Sar | 2 | 6 | 2 | 1 | ||||||||||
clade | SAR116 cluster | 1 | |||||||||||||
clade | Sauria | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Saurischia | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Sauropsida | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Silicofilosea | 1 | |||||||||||||
clade | sordariomyceta | 9 | 1 | ||||||||||||
clade | Spermatophyta | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Spiralia | 439 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||
clade | Spirocuta | 1 | |||||||||||||
clade | Stenosarchaea group | 24 | 8 | 10 | 11 | 12 | 19 | ||||||||
clade | Stramenopiles | 2 | 1 | ||||||||||||
clade | sulfur-oxidizing symbionts | 1 | 1 | ||||||||||||
clade | TACK group | 38 | 9 | 1 | 1 | ||||||||||
clade | TCBD clade | 1 | |||||||||||||
clade | Teleostomi | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
clade | Terrabacteria group | 2450 | 1538 | 792 | 66 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 29 | 18 | 7 | 3 | 3 |
clade | Tetrapoda | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
clade | Theria | 1 | 18 | ||||||||||||
clade | Theropoda | 16 | 11 | ||||||||||||
clade | Tracheophyta | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
clade | Trypanosoma with unspecified subgenus | 1 | |||||||||||||
clade | Vertebrata | 5 | 1 | 25 | 11 | 1 | |||||||||
class | Acidimicrobiia | 340 | 593 | 2 | 3 | 2 | 32 | 1 | 3 | ||||||
class | Acidithiobacillia | 45 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
class | Acidobacteriia | 395 | 997 | 111 | 4 | 2 | 35 | 4 | 2 | ||||||
class | Aconoidasida | 4 | 1 | ||||||||||||
class | Actinomycetia | 2440 | 1537 | 785 | 50 | 40 | 37 | 35 | 35 | 35 | 24 | 17 | 7 | 2 | 3 |
class | Agaricomycetes | 1 | 1 | ||||||||||||
class | algae | 2 | 2 | ||||||||||||
class | Alphaproteobacteria | 2385 | 1461 | 438 | 16 | 40 | 4 | 32 | 35 | 22 | 22 | 7 | 7 | ||
class | Amphibia | 5 | 5 | 1 | |||||||||||
class | Anaerolineae | 1014 | 349 | 9 | 1 | 10 | 35 | 4 | 7 | ||||||
class | Anthozoa | 36 | 1 | ||||||||||||
class | Aquificae | 13 | 152 | 3 | 9 | 34 | 4 | ||||||||
class | Archaeoglobi | 1 | 3 | 4 | 2 | ||||||||||
class | Ardenticatenia | 29 | 3 | 33 | 1 | ||||||||||
class | Armatimonadia | 2 | 1 | ||||||||||||
class | Aves | 16 | 11 | ||||||||||||
class | Bacillariophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Bacilli | 2450 | 1538 | 788 | 57 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 2 | 3 |
class | Bacteroidia | 2450 | 1538 | 790 | 65 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
class | Balneolia | 91 | 819 | 2 | 3 | 7 | 6 | ||||||||
class | Bangiophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Betaproteobacteria | 2439 | 1520 | 747 | 30 | 40 | 35 | 36 | 35 | 27 | 24 | 18 | 7 | 2 | 3 |
class | Bigyra | 1 | |||||||||||||
class | Bivalvia | 325 | 1 | ||||||||||||
class | Blastocatellia | 207 | 1 | 1 | 9 | 3 | |||||||||
class | Caldilineae | 789 | 588 | 2 | 5 | 17 | 3 | 7 | |||||||
class | Caldisericia | 2 | 13 | 7 | 1 | ||||||||||
class | Calditrichia | 479 | 15 | 4 | 17 | 1 | 7 | ||||||||
class | Candidatus Babeliae | 6 | 3 | ||||||||||||
class | Candidatus Brocadiia | 21 | 11 | 1 | |||||||||||
class | Candidatus Nanoarchaeia | 1 | |||||||||||||
class | Candidatus Peribacteria | 7 | |||||||||||||
class | Candidatus Sumerlaeia | 2 | |||||||||||||
class | Caudoviricetes | 1 | 6 | ||||||||||||
class | Cestoda | 1 | |||||||||||||
class | Chitinispirillia | 23 | 2 | ||||||||||||
class | Chitinivibrionia | 2 | |||||||||||||
class | Chitinophagia | 1135 | 1221 | 5 | 1 | 21 | 5 | 35 | 4 | 1 | 6 | ||||
class | Chlamydiia | 221 | 143 | 1 | 1 | 34 | 1 | 1 | |||||||
class | Chlorobia | 2019 | 109 | 1 | 1 | 25 | 35 | 4 | 2 | ||||||
class | Chloroflexia | 6 | 86 | 2 | 1 | 14 | 35 | 2 | |||||||
class | Chlorophyceae | 1 | 1 | ||||||||||||
class | Chloropicophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Choanoflagellata | 1 | |||||||||||||
class | Chromadorea | 1 | |||||||||||||
class | Chrysiogenetes | 427 | 24 | 1 | 1 | 21 | 1 | ||||||||
class | Chthonomonadetes | 6 | 175 | 10 | 3 | ||||||||||
class | Chytridiomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Clostridia | 2450 | 1538 | 792 | 64 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
class | Compsopogonophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Conoidasida | 5 | 1 | ||||||||||||
class | Coprothermobacteria | 24 | 98 | 7 | 1 | ||||||||||
class | Coriobacteriia | 2431 | 1532 | 787 | 46 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 22 | 18 | 7 | 1 | 3 |
class | Coscinodiscophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Cryptophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Cyanophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Cytophagia | 2384 | 1333 | 7 | 4 | 27 | 12 | 35 | 4 | 6 | |||||
class | Deferribacteres | 671 | 144 | 1 | 5 | 10 | 34 | 4 | 4 | ||||||
class | Dehalococcoidia | 128 | 254 | 1 | 1 | 2 | 1 | 34 | 4 | ||||||
class | Deinococci | 1524 | 288 | 7 | 1 | 20 | 13 | 35 | 5 | 7 | |||||
class | Deltaproteobacteria | 2418 | 1474 | 648 | 47 | 40 | 23 | 33 | 35 | 34 | 22 | 14 | 7 | 2 | 3 |
class | Dictyoglomia | 121 | 2 | 14 | 1 | ||||||||||
class | Dinophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Dothideomycetes | 1 | 1 | ||||||||||||
class | Elusimicrobia | 10 | 98 | 7 | 29 | 19 | 1 | 3 | 7 | ||||||
class | Endomicrobia | 22 | 1 | ||||||||||||
class | Epsilonproteobacteria | 1382 | 682 | 266 | 29 | 22 | 3 | 10 | 35 | 34 | 7 | 7 | |||
class | Erysipelotrichia | 2446 | 1537 | 786 | 26 | 40 | 36 | 36 | 35 | 29 | 21 | 17 | 7 | 1 | |
class | Euglenida | 1 | |||||||||||||
class | Eumycetozoa | 1 | |||||||||||||
class | Eurotiomycetes | 9 | 1 | 1 | |||||||||||
class | Eustigmatophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Exobasidiomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Faserviricetes | 1 | |||||||||||||
class | Fibrobacteria | 194 | 296 | 188 | 2 | 32 | 1 | ||||||||
class | Fimbriimonadia | 7 | 78 | 12 | 2 | ||||||||||
class | Flavobacteriia | 2162 | 790 | 460 | 7 | 33 | 3 | 12 | 35 | 4 | 4 | 2 | 7 | ||
class | Florideophyceae | 1 | 10 | ||||||||||||
class | Fusobacteriia | 1243 | 818 | 144 | 30 | 7 | 4 | 7 | 35 | 34 | 2 | 2 | 6 | 3 | |
class | Gammaproteobacteria | 2444 | 1536 | 721 | 45 | 40 | 35 | 36 | 35 | 34 | 26 | 18 | 7 | 2 | 3 |
class | Gastropoda | 148 | 1 | 1 | |||||||||||
class | Gemmatimonadetes | 19 | 67 | 1 | 1 | 33 | 15 | 35 | 1 | 7 | |||||
class | Glaucocystophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Gloeobacteria | 13 | 1 | 1 | 33 | 1 | |||||||||
class | Glomeromycetes | 1 | |||||||||||||
class | Halobacteria | 13 | 1 | 1 | 12 | 1 | |||||||||
class | Holophagae | 1205 | 882 | 2 | 6 | ||||||||||
class | Hydrogenophilalia | 1181 | 282 | 6 | 1 | 17 | 5 | 1 | |||||||
class | Ignavibacteria | 39 | 980 | 2 | 2 | 11 | 16 | 32 | 4 | ||||||
class | Insecta | 341 | 7 | 11 | 25 | 1 | 4 | 1 | |||||||
class | Kinetoplastea | 1 | |||||||||||||
class | Kiritimatiellae | 16 | |||||||||||||
class | Ktedonobacteria | 261 | 30 | 1 | 1 | 33 | 3 | ||||||||
class | Lentisphaeria | 404 | 285 | 3 | 6 | 6 | 6 | 34 | 1 | 2 | 5 | ||||
class | Leotiomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Limnochordia | 4 | 27 | 1 | |||||||||||
class | Magnoliopsida | 621 | 11 | 18 | 25 | 2 | 1 | 3 | |||||||
class | Malasseziomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Malgrandaviricetes | 25 | 6 | 7 | |||||||||||
class | Mamiellophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Mammalia | 1 | 18 | ||||||||||||
class | Mediophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Methanobacteria | 620 | 332 | 220 | 32 | 21 | 7 | 16 | 25 | 4 | 11 | 7 | 3 | 3 | |
class | Methanococci | 1 | 11 | 17 | |||||||||||
class | Methanomicrobia | 11 | 7 | 10 | 11 | 19 | |||||||||
class | Methylacidiphilae | 16 | 1 | 4 | 1 | ||||||||||
class | Mollicutes | 2354 | 1396 | 167 | 12 | 34 | 1 | 25 | 35 | 5 | 1 | 2 | 6 | ||
class | Mortierellomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Mucoromycetes | 1 | |||||||||||||
class | Negativicutes | 2449 | 1538 | 792 | 43 | 40 | 37 | 34 | 35 | 35 | 26 | 17 | 7 | 1 | 3 |
class | Nephroselmidophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Nitriliruptoria | 1451 | 143 | 3 | 1 | 30 | 1 | ||||||||
class | Nitrososphaeria | 21 | 1 | ||||||||||||
class | Nitrospinia | 6 | 7 | ||||||||||||
class | Nitrospira | 566 | 62 | 1 | 1 | 35 | 4 | 6 | |||||||
class | Oligoflexia | 43 | 139 | 1 | 1 | 1 | 1 | 34 | 4 | 1 | |||||
class | Oligohymenophorea | 1 | |||||||||||||
class | Oligosphaeria | 54 | 1 | ||||||||||||
class | Opitutae | 1475 | 584 | 97 | 2 | 18 | 1 | 1 | 35 | 4 | 4 | ||||
class | Pedinophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Pelagophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Pezizomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Phaeophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Phycisphaerae | 2 | 1 | 35 | 4 | ||||||||||
class | Pisoniviricetes | 1 | |||||||||||||
class | Planctomycetia | 33 | 145 | 1 | 1 | 35 | 4 | ||||||||
class | Pucciniomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Raphidophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Rhodellophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Rhodothermia | 452 | 236 | 1 | 2 | ||||||||||
class | Rhynchonellata | 1 | |||||||||||||
class | Rubrobacteria | 30 | 160 | 3 | 7 | 34 | 3 | ||||||||
class | Saccharomycetes | 13 | 27 | 9 | 6 | ||||||||||
class | Saprospiria | 101 | 237 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
class | Solibacteres | 19 | 1 | ||||||||||||
class | Sordariomycetes | 9 | 1 | ||||||||||||
class | Spartobacteria | 49 | 69 | 1 | |||||||||||
class | Sphingobacteriia | 2446 | 797 | 18 | 5 | 39 | 26 | 35 | 4 | 4 | 7 | ||||
class | Spirochaetia | 1063 | 260 | 16 | 30 | 7 | 35 | 28 | 1 | ||||||
class | Stylonematophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Synergistia | 1835 | 603 | 236 | 3 | 20 | 3 | 1 | 35 | 10 | 2 | 1 | 7 | 1 | |
class | Synurophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Taphrinomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Tepidiformia | 18 | |||||||||||||
class | Terrimicrobia | 4 | |||||||||||||
class | Thermoanaerobaculia | 101 | |||||||||||||
class | Thermococci | 4 | 1 | 5 | 3 | ||||||||||
class | Thermodesulfobacteria | 207 | 89 | 1 | 29 | 1 | 2 | ||||||||
class | Thermodesulfovibrionia Umezawa et al. 2021 | 556 | 21 | 1 | 13 | 3 | 6 | ||||||||
class | Thermoflexia | 4 | |||||||||||||
class | Thermoleophilia | 36 | 140 | 1 | 18 | 1 | |||||||||
class | Thermolithobacteria | 72 | |||||||||||||
class | Thermomicrobia | 34 | 2 | 30 | 1 | ||||||||||
class | Thermoplasmata | 46 | 36 | 11 | 1 | 2 | |||||||||
class | Thermoprotei | 10 | 1 | ||||||||||||
class | Thermotogae | 79 | 69 | 1 | 35 | 4 | 6 | ||||||||
class | Tissierellia | 2429 | 1490 | 513 | 26 | 35 | 11 | 14 | 35 | 35 | 6 | 8 | 7 | ||
class | Trebouxiophyceae | 1 | |||||||||||||
class | Trematoda | 1 | |||||||||||||
class | Tremellomycetes | 1 | 1 | 13 | |||||||||||
class | Ulvophyceae | 1 | |||||||||||||
class | unclassified Cyanobacteria | 1 | |||||||||||||
class | Ustilaginomycetes | 8 | 1 | ||||||||||||
class | Verrucomicrobiae | 2098 | 1255 | 496 | 25 | 30 | 22 | 26 | 35 | 34 | 12 | 13 | 3 | 2 | 3 |
class | Vicinamibacteria | 28 | 1 | ||||||||||||
class | Wallemiomycetes | 1 | |||||||||||||
class | Zetaproteobacteria | 61 | 1 | 1 | 31 | 1 | |||||||||
cohort | Endopterygota | 23 | 3 | ||||||||||||
cohort | Paraneoptera | 336 | 2 | 11 | 25 | 1 | |||||||||
cohort | Polyneoptera | 7 | 7 | 1 | 1 | ||||||||||
family | 'Hydrogenimonaceae' | 1 | |||||||||||||
family | 'Williamsiaceae' | 3 | 6 | ||||||||||||
family | Acanthamoebidae | 1 | |||||||||||||
family | Acanthopleuribacteraceae | 61 | |||||||||||||
family | Acaryochloridaceae | 3 | 4 | ||||||||||||
family | Acetobacteraceae | 781 | 444 | 2 | 1 | 7 | 1 | 1 | 35 | 4 | 2 | 3 | |||
family | Acholeplasmataceae | 2202 | 1053 | 19 | 2 | 9 | 15 | 35 | 5 | 6 | |||||
family | Acidaminococcaceae | 2276 | 1428 | 566 | 33 | 30 | 27 | 22 | 35 | 34 | 18 | 13 | 7 | 1 | |
family | Acidiferrobacteraceae | 19 | 33 | 4 | |||||||||||
family | Acidimicrobiaceae | 338 | 577 | 2 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
family | Acidithiobacillaceae | 45 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
family | Acidobacteriaceae | 390 | 311 | 87 | 3 | 2 | 35 | 4 | 2 | ||||||
family | Acidothermaceae | 66 | 4 | 1 | |||||||||||
family | Acrospermaceae | 1 | |||||||||||||
family | Actinomycetaceae | 1956 | 1371 | 635 | 13 | 18 | 30 | 24 | 35 | 15 | 3 | 8 | 7 | ||
family | Actinopolymorphaceae | 152 | 2 | 8 | 1 | ||||||||||
family | Actinopolysporaceae | 525 | 267 | 6 | 20 | 1 | |||||||||
family | Acytosteliaceae | 1 | |||||||||||||
family | Aerococcaceae | 1032 | 1264 | 80 | 3 | 16 | 3 | 35 | 4 | 1 | 7 | ||||
family | Aeromonadaceae | 562 | 288 | 7 | 1 | 1 | 1 | 4 | 35 | 4 | 3 | 2 | |||
family | Afifellaceae | 2 | |||||||||||||
family | Ajellomycetaceae | 1 | |||||||||||||
family | Akkermansiaceae | 2092 | 1297 | 790 | 26 | 15 | 34 | 36 | 35 | 34 | 19 | 18 | 4 | 2 | 3 |
family | Albuginaceae | 1 | |||||||||||||
family | Alcaligenaceae | 2407 | 233 | 6 | 2 | 9 | 10 | 35 | 4 | 1 | 7 | ||||
family | Alcanivoracaceae | 309 | 26 | 1 | 35 | 1 | |||||||||
family | Alcidae | 11 | |||||||||||||
family | Algiphilaceae | 48 | |||||||||||||
family | Alicyclobacillaceae | 6 | 642 | 3 | 6 | 7 | 35 | 4 | |||||||
family | Alsobacteraceae | 2 | |||||||||||||
family | Alteromonadaceae | 838 | 578 | 1 | 3 | 35 | 4 | 1 | 2 | ||||||
family | Amaranthaceae | 8 | |||||||||||||
family | Amoebophilaceae | 2232 | 3 | 1 | 18 | 1 | 5 | ||||||||
family | Amphipleuraceae | 1 | |||||||||||||
family | Anaerohalosphaeraceae | 13 | |||||||||||||
family | Anaerolineaceae | 438 | 348 | 8 | 1 | 5 | 35 | 4 | |||||||
family | Anaeromyxobacteraceae | 1 | 683 | 1 | 1 | 35 | 1 | ||||||||
family | Anaeroplasmataceae | 274 | 568 | 128 | 1 | 12 | 3 | 2 | 2 | ||||||
family | anamorphic Herpotrichiellaceae | 1 | 1 | ||||||||||||
family | Anaplasmataceae | 684 | 28 | 1 | 2 | 1 | 31 | 4 | 2 | ||||||
family | Anaulaceae | 1 | |||||||||||||
family | Aphanizomenonaceae | 1648 | 3 | 14 | 17 | 4 | 7 | ||||||||
family | Aphanothecaceae | 1 | 8 | 1 | 26 | 1 | |||||||||
family | Aphididae | 4 | 25 | ||||||||||||
family | Aquificaceae | 13 | 102 | 2 | 9 | 20 | 3 | ||||||||
family | Archaeoglobaceae | 3 | 4 | 2 | |||||||||||
family | Archangiaceae | 99 | 94 | 1 | 34 | 1 | |||||||||
family | Arcobacteraceae Waite et al. 2017 | 135 | 22 | 1 | 1 | 34 | 4 | 1 | |||||||
family | Ardenticatenaceae | 29 | 3 | 33 | 1 | ||||||||||
family | Armatimonadaceae | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Aspergillaceae | 9 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Asteraceae | 25 | |||||||||||||
family | Atopobiaceae | 912 | 1058 | 165 | 11 | 8 | 4 | 10 | 35 | 28 | 3 | ||||
family | Aurantimonadaceae | 35 | 19 | 1 | 35 | 1 | |||||||||
family | Azonexaceae | 201 | 25 | 1 | 1 | 33 | |||||||||
family | Azospirillaceae | 1250 | 714 | 1 | 1 | 13 | 2 | 35 | 4 | 4 | 2 | ||||
family | Babesiidae | 1 | |||||||||||||
family | Babyloniidae | 3 | |||||||||||||
family | Bacillaceae | 2270 | 1191 | 232 | 14 | 39 | 4 | 31 | 35 | 35 | 12 | 7 | |||
family | Bacillales Family X. Incertae Sedis | 2430 | 842 | 3 | 22 | 7 | |||||||||
family | Bacillariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Bacillidae | 7 | 6 | 1 | 1 | ||||||||||
family | bacterial virus | 1 | |||||||||||||
family | Bacteriovoracaceae | 10 | 91 | 1 | 1 | 12 | 1 | ||||||||
family | Bacteroidaceae | 2450 | 1538 | 784 | 62 | 40 | 37 | 35 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
family | Baekduiaceae An et al. 2018 | 15 | |||||||||||||
family | Balneatrichaceae | 34 | |||||||||||||
family | Balneicellaceae | 21 | |||||||||||||
family | Balneolaceae | 91 | 815 | 2 | 3 | 1 | 6 | ||||||||
family | Bangiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Barnesiellaceae | 1289 | 515 | 16 | 14 | 17 | 11 | 35 | 34 | 18 | 18 | 2 | |||
family | Bartonellaceae | 96 | 15 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
family | Bathycoccaceae | 1 | |||||||||||||
family | Bdellovibrionaceae | 34 | 10 | 1 | 1 | 33 | 1 | 1 | |||||||
family | Beijerinckiaceae | 80 | 16 | 1 | 33 | 4 | |||||||||
family | Berkeleyaceae | 1 | |||||||||||||
family | Bernardetiaceae | 146 | 2 | 13 | 1 | ||||||||||
family | Beutenbergiaceae | 23 | 1 | ||||||||||||
family | Bifidobacteriaceae | 2421 | 1527 | 791 | 39 | 39 | 35 | 36 | 35 | 35 | 25 | 18 | 7 | 2 | 3 |
family | Blastocatellaceae | 21 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Blastochloridaceae | 9 | 24 | 1 | |||||||||||
family | Blastocystidae | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Blattabacteriaceae | 1 | 32 | 4 | |||||||||||
family | Bogoriellaceae | 31 | 51 | 30 | 6 | ||||||||||
family | Boletaceae | 1 | |||||||||||||
family | Bondarzewiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Borreliaceae | 22 | 2 | 9 | 24 | 4 | |||||||||
family | Boseaceae | 7 | 1 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
family | Brachyspiraceae | 25 | 13 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Bradymonadaceae | 32 | 1 | ||||||||||||
family | Bradyrhizobiaceae | 107 | 74 | 11 | 1 | 1 | 35 | 4 | 1 | 1 | |||||
family | Breoghaniaceae | 12 | 1 | ||||||||||||
family | Brevibacteriaceae | 205 | 169 | 60 | 9 | 35 | 33 | 1 | 7 | ||||||
family | Brevinemataceae | 5 | 1 | ||||||||||||
family | Brucellaceae | 245 | 51 | 25 | 1 | 4 | 4 | 35 | 4 | 1 | |||||
family | Bruguierivoracaceae Li et al. 2021 | 8 | 29 | 1 | 28 | 4 | |||||||||
family | Bryobacteraceae | 20 | 1 | ||||||||||||
family | Budviciaceae | 308 | 1 | 1 | 29 | 4 | 20 | ||||||||
family | Burkholderiaceae | 2172 | 513 | 27 | 6 | 32 | 17 | 35 | 4 | 1 | 3 | 7 | |||
family | Caedimonadaceae | 1 | |||||||||||||
family | Caldicoprobacteraceae | 54 | 237 | ||||||||||||
family | Caldilineaceae | 789 | 586 | 2 | 5 | 17 | 3 | 7 | |||||||
family | Caldisericaceae | 1 | 13 | 7 | 1 | ||||||||||
family | Caldisphaeraceae | 2 | |||||||||||||
family | Calditrichaceae | 479 | 15 | 4 | 17 | 1 | 7 | ||||||||
family | Caliciviridae | 1 | |||||||||||||
family | Callithamniaceae | 1 | |||||||||||||
family | Calotrichaceae | 1011 | 138 | 1 | 5 | 34 | 5 | 6 | |||||||
family | Campylobacteraceae | 990 | 575 | 265 | 28 | 12 | 3 | 7 | 35 | 34 | 7 | 7 | |||
family | Candidatus Babeliaceae | 6 | 3 | ||||||||||||
family | Candidatus Brocadiaceae | 21 | 11 | 1 | |||||||||||
family | Candidatus Competibacteraceae | 191 | 2 | 1 | |||||||||||
family | Candidatus Desulfofervidaceae | 3 | 1 | ||||||||||||
family | Candidatus Fermentimicrarchaeaceae | 1 | |||||||||||||
family | Candidatus Methanomethylophilaceae | 23 | |||||||||||||
family | Candidatus Methanoperedenaceae | 1 | |||||||||||||
family | Candidatus Midichloriaceae | 1 | 1 | ||||||||||||
family | Candidatus Nanopelagicaceae | 1 | 33 | 3 | |||||||||||
family | Candidatus Paracaedibacteraceae | 1 | |||||||||||||
family | Candidatus Scalinduaceae Lodha et al. 2021 | 21 | |||||||||||||
family | Candidatus Sumerlaeaceae | 2 | |||||||||||||
family | Canidae | 18 | |||||||||||||
family | Capillimicrobiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cardiobacteriaceae | 59 | 183 | 2 | 1 | 29 | 1 | ||||||||
family | Carnobacteriaceae | 1554 | 883 | 326 | 5 | 17 | 13 | 5 | 35 | 5 | 1 | 3 | 7 | ||
family | Casimicrobiaceae Song et al. 2020 | 16 | |||||||||||||
family | Catabacteriaceae | 255 | 100 | 8 | 1 | 1 | 1 | 6 | |||||||
family | Catalimonadaceae | 69 | |||||||||||||
family | Catenulisporaceae | 8 | 13 | 4 | |||||||||||
family | Caulerpaceae | 1 | |||||||||||||
family | Caulobacteraceae | 1097 | 221 | 9 | 1 | 20 | 35 | 4 | 4 | 1 | |||||
family | Cavenderiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Celerinatantimonadaceae | 6 | |||||||||||||
family | Cellulomonadaceae | 182 | 147 | 1 | 4 | 35 | 4 | ||||||||
family | Cellulosilyticaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cellvibrionaceae | 184 | 91 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Cenarchaeaceae DeLong and Preston 1996 | 9 | |||||||||||||
family | Ceramiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cesiribacteraceae | 65 | |||||||||||||
family | Chaetocerotaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chaetomiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chamaesiphonaceae | 5 | 3 | ||||||||||||
family | Chattonellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chelatococcaceae | 12 | 8 | 19 | 1 | ||||||||||
family | Chitinispirillaceae | 23 | 2 | ||||||||||||
family | Chitinivibrionaceae | 2 | |||||||||||||
family | Chitinophagaceae | 1139 | 1221 | 5 | 1 | 21 | 5 | 35 | 4 | 1 | 6 | ||||
family | Chlamydiaceae | 1 | 2 | 1 | 21 | 1 | |||||||||
family | Chlamydomonadaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chlorellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chlorobiaceae | 2019 | 109 | 1 | 25 | 35 | 4 | 2 | |||||||
family | Chloroflexaceae | 14 | 2 | 15 | 2 | ||||||||||
family | Chlorogloeopsidaceae | 19 | |||||||||||||
family | Chloropicaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chlorosarcinaceae | 1 | |||||||||||||
family | Christensenellaceae | 381 | 181 | 3 | 15 | 28 | 24 | 35 | 5 | 2 | 14 | 7 | 1 | ||
family | Chromatiaceae | 2009 | 738 | 2 | 3 | 17 | 1 | 35 | 4 | 6 | |||||
family | Chromobacteriaceae | 319 | 143 | 9 | 35 | 12 | 1 | ||||||||
family | Chroococcaceae | 1012 | 2 | 12 | 1 | 2 | |||||||||
family | Chroococcidiopsidaceae | 5 | 1 | 27 | 1 | ||||||||||
family | Chrysiogenaceae | 431 | 24 | 1 | 1 | 21 | 1 | ||||||||
family | Chrysochromulinaceae | 1 | |||||||||||||
family | Chthoniobacteraceae | 49 | 12 | ||||||||||||
family | Chthonomonadaceae | 6 | 175 | 10 | 3 | ||||||||||
family | Clavicipitaceae | 1 | |||||||||||||
family | Clostridiaceae | 2449 | 1538 | 789 | 56 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 25 | 17 | 7 | 1 | 3 |
family | Clostridiales Family XI. Incertae Sedis | 217 | |||||||||||||
family | Clostridiales Family XVI. Incertae Sedis | 1388 | 92 | 4 | 3 | 31 | 1 | 2 | |||||||
family | Clostridiales Family XVII. Incertae Sedis | 83 | 206 | 1 | 7 | 1 | 35 | 5 | 2 | ||||||
family | Coccidae | 271 | 3 | ||||||||||||
family | Coelosphaeriaceae | 59 | |||||||||||||
family | Cohaesibacteraceae | 1 | 25 | 1 | |||||||||||
family | Coleofasciculaceae | 16 | 14 | 16 | |||||||||||
family | Collodictyonidae | 1 | |||||||||||||
family | Colwelliaceae | 4 | 214 | 1 | 2 | 34 | 4 | ||||||||
family | Comamonadaceae | 2177 | 271 | 112 | 4 | 15 | 3 | 35 | 4 | 9 | 6 | ||||
family | Compsopogonaceae | 1 | |||||||||||||
family | Conexibacteraceae | 10 | 8 | 16 | |||||||||||
family | Coniophoraceae | 1 | |||||||||||||
family | Coprobacillaceae Verbarg et al. 2014 | 2422 | 1238 | 395 | 9 | 28 | 32 | 5 | 8 | 3 | 11 | 7 | |||
family | Coprothermobacteraceae | 24 | 98 | 7 | 1 | ||||||||||
family | Cordycipitaceae | 1 | |||||||||||||
family | Coriobacteriaceae | 2431 | 1377 | 783 | 31 | 32 | 28 | 34 | 35 | 35 | 18 | 7 | 3 | ||
family | Corynebacteriaceae | 1215 | 874 | 444 | 22 | 25 | 13 | 8 | 35 | 34 | 7 | 7 | 1 | ||
family | Coxiellaceae | 62 | 51 | 2 | 1 | 25 | 1 | 1 | |||||||
family | Crenotrichaceae | 4 | |||||||||||||
family | Criblamydiaceae | 45 | |||||||||||||
family | Crocinitomicaceae | 3 | 31 | 1 | 3 | 31 | 1 | ||||||||
family | Cryomorphaceae | 3 | 144 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
family | Cryphonectriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cryptococcaceae | 13 | |||||||||||||
family | Cryptosporangiaceae | 3 | 1 | ||||||||||||
family | Cryptosporidiidae | 5 | |||||||||||||
family | Cucurbitariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cyanidiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Cyanobacteriaceae | 372 | 47 | 1 | |||||||||||
family | Cyanobacteriaceae | 372 | 47 | 16 | 1 | ||||||||||
family | Cyanobiaceae Salazar et al., 2020 | 5 | 8 | 1 | 1 | 35 | 4 | ||||||||
family | Cyanophoraceae | 1 | |||||||||||||
family | Cyanothecaceae | 7 | 1 | ||||||||||||
family | Cyclobacteriaceae | 390 | 1 | 35 | 4 | ||||||||||
family | Cyphellophoraceae | 1 | |||||||||||||
family | Cytophagaceae | 2264 | 1065 | 3 | 1 | 5 | 4 | 35 | 4 | 6 | |||||
family | Dasyaceae | 1 | |||||||||||||
family | Debaryomycetaceae | 10 | 9 | ||||||||||||
family | Deferribacteraceae | 676 | 144 | 1 | 5 | 10 | 34 | 4 | 4 | ||||||
family | Defluviitaleaceae | 429 | 18 | 3 | 14 | 3 | |||||||||
family | Dehalococcoidaceae | 128 | 72 | 1 | 1 | 1 | 33 | 1 | |||||||
family | Deinococcaceae | 1148 | 188 | 6 | 1 | 11 | 1 | 35 | 5 | 4 | |||||
family | Demequinaceae | 22 | 84 | 1 | |||||||||||
family | Dermabacteraceae | 448 | 103 | 55 | 1 | 7 | 35 | 5 | 1 | ||||||
family | Dermacoccaceae | 19 | 37 | 2 | 1 | 1 | 33 | 1 | 1 | ||||||
family | Dermatophilaceae | 2 | 13 | 30 | 1 | ||||||||||
family | Dermocarpellaceae | 4 | 7 | 1 | |||||||||||
family | Desulfallaceae Watanabe et al. 2020 | 1091 | 350 | 3 | 1 | 29 | 1 | 7 | |||||||
family | Desulfarculaceae | 278 | 5 | 32 | 1 | ||||||||||
family | Desulfitobacteriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Desulfobacteraceae | 557 | 859 | 2 | 17 | 7 | 2 | 35 | 15 | 2 | |||||
family | Desulfobulbaceae | 32 | 244 | 11 | 1 | 35 | 14 | ||||||||
family | Desulfocapsaceae | 18 | 17 | 11 | 34 | 6 | |||||||||
family | Desulfohalobiaceae | 404 | 90 | 1 | 16 | 3 | 7 | ||||||||
family | Desulfomicrobiaceae | 136 | 333 | 11 | 8 | 35 | 25 | ||||||||
family | Desulfonatronaceae | 481 | 51 | 2 | |||||||||||
family | Desulfovibrionaceae | 2353 | 1335 | 648 | 43 | 35 | 23 | 32 | 35 | 34 | 22 | 14 | 7 | 2 | 3 |
family | Desulfurellaceae | 7 | 17 | 4 | 13 | 12 | |||||||||
family | Desulfurobacteriaceae | 42 | 17 | 1 | |||||||||||
family | Desulfurococcaceae | 4 | |||||||||||||
family | Desulfuromonadaceae | 1218 | 124 | 14 | 11 | 35 | 19 | 5 | |||||||
family | Devosiaceae | 834 | 86 | 4 | 33 | 4 | 1 | ||||||||
family | Diapheromeridae | 1 | |||||||||||||
family | Diaporthaceae | 1 | |||||||||||||
family | Dictyoglomaceae | 121 | 2 | 14 | 1 | ||||||||||
family | Dictyosteliaceae | 1 | |||||||||||||
family | Didymellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Didymosphaeriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Dientamoebidae | 1 | |||||||||||||
family | Dietziaceae | 130 | 214 | 2 | 33 | 1 | 7 | ||||||||
family | Diphyllobothriidae | 1 | |||||||||||||
family | Dipodascaceae | 1 | |||||||||||||
family | Dixoniellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Dunaliellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Dysgonomonadaceae | 2004 | 995 | 46 | 11 | 7 | 4 | 35 | 4 | 2 | 7 | ||||
family | Ectothiorhodospiraceae | 1726 | 334 | 1 | 3 | 7 | 35 | 4 | 2 | ||||||
family | Edwardsiidae | 36 | 1 | ||||||||||||
family | Eggerthellaceae | 2406 | 1501 | 775 | 46 | 40 | 37 | 35 | 35 | 35 | 22 | 14 | 7 | 1 | 3 |
family | Egibacteraceae | 7 | 1 | ||||||||||||
family | Egicoccaceae | 13 | 1 | ||||||||||||
family | Eimeriidae | 1 | |||||||||||||
family | Elioraeaceae | 3 | |||||||||||||
family | Elusimicrobiaceae | 10 | 79 | 7 | 1 | 1 | 3 | ||||||||
family | Emcibacteraceae | 257 | 5 | 20 | |||||||||||
family | Endomicrobiaceae | 22 | 1 | ||||||||||||
family | Endozoicomonadaceae | 6 | 11 | 1 | |||||||||||
family | Enterobacteriaceae | 2358 | 938 | 595 | 44 | 40 | 30 | 32 | 35 | 34 | 23 | 17 | 7 | 2 | 3 |
family | Enterococcaceae | 2233 | 534 | 140 | 32 | 30 | 29 | 28 | 35 | 35 | 6 | 11 | 4 | 2 | |
family | Entomoplasmataceae | 1067 | 126 | 1 | 4 | 29 | 5 | 2 | |||||||
family | Eriococcidae | 1 | 11 | ||||||||||||
family | Erwiniaceae | 588 | 449 | 177 | 2 | 2 | 4 | 35 | 4 | 11 | 2 | ||||
family | Erysipelotrichaceae | 2446 | 1537 | 786 | 26 | 39 | 36 | 36 | 35 | 29 | 21 | 17 | 7 | 1 | |
family | Erythrobacteraceae | 207 | 67 | 2 | 1 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||
family | Erythrotrichiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Eubacteriaceae | 2435 | 1538 | 301 | 28 | 40 | 37 | 36 | 35 | 32 | 24 | 13 | 7 | 3 | |
family | Eubacteriales Family XII. Incertae Sedis | 680 | 895 | 18 | 6 | 8 | 6 | ||||||||
family | Eubacteriales Family XIII. Incertae Sedis | 2049 | 1452 | 658 | 8 | 40 | 19 | 31 | 35 | 9 | 3 | 12 | 7 | 1 | |
family | Euglenaceae | 1 | |||||||||||||
family | Euzebyaceae | 1450 | 137 | 1 | 1 | 15 | 1 | ||||||||
family | Fabaceae | 616 | 11 | 1 | 2 | 1 | 3 | ||||||||
family | Fastidiosibacteraceae | 18 | |||||||||||||
family | Faucheaceae | 10 | |||||||||||||
family | Ferrimonadaceae | 23 | 55 | 27 | 1 | ||||||||||
family | Ferrovaceae | 5 | 2 | ||||||||||||
family | Fervidobacteriaceae | 27 | 1 | 1 | 30 | 4 | 1 | ||||||||
family | Fibrobacteraceae | 194 | 276 | 141 | 2 | 32 | 1 | ||||||||
family | Filobasidiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Fimbriimonadaceae | 7 | 78 | 12 | 2 | ||||||||||
family | Flammeovirgaceae | 608 | 483 | 1 | 3 | 6 | 33 | 4 | |||||||
family | Flavobacteriaceae | 2162 | 690 | 457 | 7 | 33 | 1 | 3 | 35 | 4 | 2 | 7 | |||
family | Flexibacteraceae | 8 | 1 | 12 | 2 | ||||||||||
family | Fortieaceae | 16 | |||||||||||||
family | four o'clock family | 2 | |||||||||||||
family | Francisellaceae | 99 | 91 | 2 | 2 | 35 | 4 | 1 | |||||||
family | Frankiaceae | 5 | 10 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
family | Fulvivirgaceae | 12 | 209 | 2 | 1 | 27 | 4 | ||||||||
family | Fusobacteriaceae | 1137 | 681 | 121 | 29 | 4 | 4 | 7 | 35 | 34 | 2 | 2 | 6 | 3 | |
family | Gaiellaceae | 61 | 2 | ||||||||||||
family | Galaxauraceae | 1 | |||||||||||||
family | Gallionellaceae | 343 | 32 | 1 | 34 | 1 | 2 | ||||||||
family | Geminicoccaceae | 99 | 7 | ||||||||||||
family | Geminigeraceae | 1 | |||||||||||||
family | Gemmataceae | 13 | 16 | 1 | 1 | 35 | 1 | ||||||||
family | Gemmatimonadaceae | 19 | 51 | 1 | 1 | 35 | 1 | ||||||||
family | Geobacteraceae | 148 | 80 | 7 | 6 | 35 | 4 | 1 | |||||||
family | Geodermatophilaceae | 45 | 153 | 1 | 1 | 27 | 4 | ||||||||
family | Gigartinaceae | 1 | |||||||||||||
family | Gloeobacteraceae | 13 | 1 | 1 | 33 | 1 | |||||||||
family | Gloeomargaritaceae | 1 | |||||||||||||
family | Gloeotrichiaceae | 3 | |||||||||||||
family | Glomeraceae | 1 | |||||||||||||
family | Glomerellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Glycomycetaceae | 110 | 189 | 2 | 16 | 1 | 1 | ||||||||
family | Gomontiellaceae | 113 | 2 | 1 | |||||||||||
family | Gomphosphaeriaceae | 59 | |||||||||||||
family | Gordoniaceae | 92 | 159 | 1 | 1 | 35 | 5 | ||||||||
family | Gottschalkiaceae | 224 | 12 | 3 | 30 | 27 | |||||||||
family | Gracilibacteraceae | 717 | 10 | 3 | 7 | 3 | |||||||||
family | Granulosicoccaceae | 94 | 26 | 1 | |||||||||||
family | great apes | 1 | 1 | ||||||||||||
family | Gregarinidae | 1 | |||||||||||||
family | Haematococcaceae | 1 | |||||||||||||
family | Haemonchidae | 1 | |||||||||||||
family | Hafniaceae | 131 | 64 | 14 | 13 | 1 | 2 | 2 | 35 | 13 | |||||
family | Hahellaceae | 290 | 249 | 2 | 1 | 19 | 3 | ||||||||
family | Halanaerobiaceae | 507 | 339 | 1 | 3 | 13 | 35 | 4 | 2 | ||||||
family | Halieaceae | 86 | 1 | 34 | 1 | ||||||||||
family | Halimedaceae | 1 | |||||||||||||
family | Haliscomenobacteraceae | 1 | 134 | 17 | 3 | ||||||||||
family | Haloarculaceae | 8 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Halobacteriaceae | 13 | 1 | 1 | 12 | 1 | |||||||||
family | Halobacteriaceae Clade I | 2 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Halobacteriovoraceae | 9 | 38 | 1 | 24 | 4 | |||||||||
family | Halobacteroidaceae | 71 | 557 | 3 | 3 | 29 | 2 | 4 | |||||||
family | Haloferacaceae | 1 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Halomonadaceae | 929 | 605 | 4 | 7 | 1 | 2 | 35 | 4 | 3 | |||||
family | Haloplasmataceae | 25 | 1 | 2 | |||||||||||
family | Halorubraceae | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Halothiobacillaceae | 45 | 155 | 2 | 20 | ||||||||||
family | Hapalidiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Hapalosiphonaceae | 12 | 1 | ||||||||||||
family | Helicobacteraceae | 734 | 64 | 3 | 26 | 4 | 35 | 33 | 1 | ||||||
family | Heliobacteriaceae | 1050 | 322 | 2 | 13 | 4 | 35 | 1 | 7 | 5 | |||||
family | Herpetosiphonaceae | 2 | 7 | ||||||||||||
family | Hesperiidae | 23 | |||||||||||||
family | Heteroderidae | 1 | |||||||||||||
family | Heteroleibleiniaceae | 17 | |||||||||||||
family | Histionidae | 1 | |||||||||||||
family | Holophagaceae | 1205 | 835 | 2 | 5 | ||||||||||
family | Holosporaceae | 1 | 5 | 3 | |||||||||||
family | Hoplolaimidae | 1 | |||||||||||||
family | Hungateiclostridiaceae | 592 | 723 | 142 | 1 | 8 | 7 | 35 | 4 | 6 | 6 | ||||
family | Hydrogenophilaceae | 1185 | 281 | 5 | 1 | 17 | 5 | 1 | |||||||
family | Hydrogenothermaceae | 34 | 1 | 26 | 1 | ||||||||||
family | Hyellaceae | 3 | 1 | ||||||||||||
family | Hymenobacteraceae | 1692 | 268 | 2 | 1 | 10 | 35 | 4 | 1 | ||||||
family | Hymenolepididae | 1 | |||||||||||||
family | Hyphomicrobiaceae | 1159 | 163 | 1 | 9 | 35 | 4 | 1 | 5 | ||||||
family | Hyphomonadaceae | 141 | 863 | 1 | 1 | 5 | 33 | 4 | 3 | ||||||
family | Hypocreaceae | 1 | |||||||||||||
family | Iamiaceae | 2 | 29 | 19 | |||||||||||
family | Icacinaceae | 17 | |||||||||||||
family | Ichthyobacteriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Idiomarinaceae | 88 | 49 | 1 | 1 | 24 | 1 | ||||||||
family | Ignavibacteriaceae | 39 | 57 | 1 | 14 | 1 | |||||||||
family | Ilumatobacteraceae | 167 | 19 | ||||||||||||
family | Immundisolibacteraceae | 12 | 3 | ||||||||||||
family | Intrasporangiaceae | 92 | 96 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Isosphaeraceae | 13 | 5 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
family | Jatrophihabitantaceae | 10 | 11 | 1 | |||||||||||
family | Jiangellaceae | 36 | 19 | 23 | 4 | 1 | |||||||||
family | Jonesiaceae | 68 | 122 | 11 | |||||||||||
family | Kaistiaceae | 16 | 43 | 1 | |||||||||||
family | Kallotenuaceae | 23 | |||||||||||||
family | Kangiellaceae | 47 | 13 | 1 | |||||||||||
family | Kareniaceae | 1 | |||||||||||||
family | Kiloniellaceae | 553 | 605 | 2 | 5 | ||||||||||
family | Kineosporiaceae | 38 | 125 | 1 | 11 | 1 | |||||||||
family | Kiritimatiellaceae | 15 | |||||||||||||
family | Kofleriaceae | 214 | 40 | 5 | 23 | 3 | |||||||||
family | Kordiimonadaceae | 259 | |||||||||||||
family | Kosmotogaceae | 21 | 6 | 1 | 24 | 1 | |||||||||
family | Kribbellaceae | 144 | 425 | 2 | 9 | 5 | |||||||||
family | Ktedonobacteraceae | 1 | |||||||||||||
family | Ktedonosporobacteraceae | 19 | |||||||||||||
family | Kytococcaceae | 1 | 1 | 2 | 20 | 1 | |||||||||
family | Labilitrichaceae | 51 | 19 | ||||||||||||
family | Lachnospiraceae | 2450 | 1538 | 791 | 61 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
family | Lacipirellulaceae | 17 | 21 | ||||||||||||
family | Lactobacillaceae | 2386 | 1538 | 792 | 32 | 35 | 36 | 36 | 35 | 35 | 15 | 18 | 7 | 3 | |
family | Laminariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Laqueidae | 1 | |||||||||||||
family | Lawsonellaceae | 1 | 33 | 2 | |||||||||||
family | Legionellaceae | 1642 | 94 | 1 | 1 | 20 | 35 | 4 | 3 | ||||||
family | Lentisphaeraceae | 4 | |||||||||||||
family | Leptolyngbyaceae | 551 | 5 | 1 | 1 | 28 | 4 | 2 | |||||||
family | Leptosphaeriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Leptospiraceae | 653 | 80 | 4 | 2 | 31 | 4 | ||||||||
family | Leptotrichiaceae | 263 | 286 | 38 | 2 | 3 | 35 | 4 | 1 | ||||||
family | Leuconostocaceae | 1885 | 1419 | 102 | 1 | 9 | 3 | 9 | 4 | 8 | 2 | 6 | |||
family | Lewinellaceae | 99 | 11 | 1 | |||||||||||
family | Lichenihabitantaceae | 4 | 1 | ||||||||||||
family | Lichtheimiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Limnochordaceae | 4 | 27 | 1 | |||||||||||
family | Listeriaceae | 1610 | 368 | 1 | 9 | 3 | 1 | 35 | 12 | 4 | 1 | ||||
family | Litoricolaceae | 171 | 59 | 1 | 4 | 3 | |||||||||
family | Luteibaculaceae Bowman 2020 | 1 | |||||||||||||
family | Magnetococcaceae | 23 | 1 | 30 | 1 | ||||||||||
family | Malasseziaceae | 1 | |||||||||||||
family | Mallomonadaceae | 1 | |||||||||||||
family | Mamiellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Maricaulaceae | 19 | 47 | 11 | 1 | ||||||||||
family | Marinifilaceae | 350 | 1 | 4 | 31 | 4 | |||||||||
family | Marinilabiliaceae | 787 | 1 | 11 | 7 | 28 | 1 | ||||||||
family | Marinobacteraceae Liao et al. 2020 | 113 | 222 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||||
family | Mariprofundaceae | 61 | 1 | 1 | 31 | 1 | |||||||||
family | Marivirgaceae | 3 | 2 | 4 | 1 | ||||||||||
family | Mastigamoebidae | 1 | |||||||||||||
family | Melioribacteraceae | 969 | 2 | 11 | 16 | 3 | 4 | ||||||||
family | Merismopediaceae | 3 | 12 | ||||||||||||
family | Mesoaciditogaceae | 8 | |||||||||||||
family | Methanobacteriaceae | 620 | 327 | 220 | 32 | 11 | 7 | 3 | 25 | 4 | 11 | 1 | 3 | 3 | |
family | Methanocaldococcaceae | 1 | 10 | 5 | |||||||||||
family | Methanococcaceae | 1 | 11 | 18 | |||||||||||
family | Methanocorpusculaceae | 4 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||
family | Methanomassiliicoccaceae | 46 | 31 | 11 | 1 | 2 | |||||||||
family | Methanomicrobiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Methanoregulaceae | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Methanosarcinaceae | 7 | 3 | 11 | 19 | ||||||||||
family | Methanospirillaceae | 1 | |||||||||||||
family | Methanotrichaceae | 1 | 1 | ||||||||||||
family | Methylacidiphilaceae | 16 | 1 | 4 | 1 | ||||||||||
family | Methylobacteriaceae | 163 | 85 | 4 | 1 | 35 | 4 | ||||||||
family | Methylococcaceae | 11 | 276 | 1 | 3 | 35 | 4 | ||||||||
family | Methylocystaceae | 44 | 32 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
family | Methylophilaceae | 1032 | 350 | 1 | 2 | 34 | 1 | 2 | |||||||
family | Methylothermaceae | 65 | 1 | ||||||||||||
family | Metschnikowiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Microbacteriaceae | 805 | 855 | 49 | 2 | 5 | 35 | 5 | 3 | 5 | |||||
family | Microbulbiferaceae | 10 | 1 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Micrococcaceae | 912 | 775 | 151 | 13 | 4 | 22 | 25 | 35 | 26 | 2 | 1 | 6 | ||
family | Microcoleaceae | 539 | 465 | 1 | 1 | 2 | 28 | 5 | 1 | ||||||
family | Microcystaceae | 9 | 2 | 8 | 1 | ||||||||||
family | Micromonosporaceae | 770 | 382 | 1 | 1 | 4 | 35 | 5 | 1 | 6 | |||||
family | Micropepsaceae | 15 | |||||||||||||
family | Microscillaceae | 211 | 1 | ||||||||||||
family | Microviridae | 25 | 6 | 7 | |||||||||||
family | Miltoncostaeaceae | 1 | |||||||||||||
family | Monodopsidaceae | 1 | |||||||||||||
family | Monomastigaceae | 1 | |||||||||||||
family | Mooreiaceae | 11 | |||||||||||||
family | Moraxellaceae | 1254 | 684 | 21 | 21 | 24 | 4 | 7 | 35 | 34 | 15 | 5 | 6 | ||
family | Morchellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Morganellaceae | 362 | 624 | 17 | 24 | 16 | 1 | 17 | 35 | 32 | 1 | 10 | 7 | ||
family | Moritellaceae | 1 | 1 | 1 | 13 | 1 | |||||||||
family | Mortierellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Motilibacteraceae | 11 | |||||||||||||
family | Muribaculaceae | 2 | 1 | 35 | 4 | 2 | |||||||||
family | Mychonastaceae | 1 | |||||||||||||
family | Mycobacteriaceae | 391 | 130 | 59 | 1 | 7 | 2 | 35 | 5 | 1 | |||||
family | Mycoplasmataceae | 2041 | 1110 | 11 | 10 | 24 | 6 | 35 | 5 | 1 | 5 | ||||
family | Mycoplasmoidaceae | 145 | 5 | 1 | |||||||||||
family | Mycosphaerellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Myoviridae | 1 | 6 | ||||||||||||
family | Mytilinidiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Myxococcaceae | 3 | 4 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Mzabimycetaceae | 208 | |||||||||||||
family | Nakamurellaceae | 2 | 1 | 32 | 4 | ||||||||||
family | Nannocystaceae | 146 | 28 | 1 | |||||||||||
family | Nanopusillaceae | 1 | |||||||||||||
family | Natranaerobiaceae | 62 | 10 | 1 | |||||||||||
family | Nautiliaceae | 5 | 50 | 1 | 2 | 30 | 1 | ||||||||
family | Nectriaceae | 8 | 1 | ||||||||||||
family | Neisseriaceae | 759 | 235 | 68 | 2 | 16 | 5 | 10 | 35 | 4 | 3 | 3 | 7 | 2 | |
family | Neomegalonemataceae | 30 | 1 | ||||||||||||
family | Nephroselmidaceae | 1 | |||||||||||||
family | Nitratiruptoraceae Waite et al. 2017 | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Nitriliruptoraceae | 7 | 6 | 2 | |||||||||||
family | Nitrosomonadaceae | 29 | 411 | 8 | 3 | 3 | 4 | 34 | 4 | ||||||
family | Nitrosopumilaceae | 6 | 8 | 1 | 1 | ||||||||||
family | Nitrososphaeraceae | 21 | 1 | ||||||||||||
family | Nitrospinaceae | 6 | 7 | ||||||||||||
family | Nitrospiraceae | 566 | 62 | 1 | 1 | 35 | 4 | 5 | |||||||
family | Nocardiaceae | 297 | 46 | 21 | 1 | 2 | 35 | 5 | 1 | ||||||
family | Nocardioidaceae | 362 | 564 | 1 | 2 | 35 | 5 | 6 | |||||||
family | Nocardiopsaceae | 2 | 451 | 1 | 1 | 34 | 4 | 2 | |||||||
family | Noelaerhabdaceae | 1 | |||||||||||||
family | Nostocaceae | 2094 | 5 | 1 | 17 | 2 | 34 | 5 | 7 | ||||||
family | Oceanospirillaceae | 599 | 441 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||||
family | Oculatellaceae | 5 | 6 | ||||||||||||
family | Odoribacteraceae | 2288 | 1410 | 621 | 36 | 33 | 29 | 33 | 35 | 35 | 24 | 16 | 7 | 2 | 3 |
family | Oedogoniaceae | 1 | |||||||||||||
family | Oleiphilaceae | 4 | 3 | ||||||||||||
family | Oligoflexaceae | 1 | |||||||||||||
family | Oligosphaeraceae | 54 | |||||||||||||
family | Onchocercidae | 1 | |||||||||||||
family | Ophiostomataceae | 1 | |||||||||||||
family | Opitutaceae | 28 | 54 | 1 | 1 | 1 | 35 | 4 | |||||||
family | Orbaceae | 16 | 1 | 27 | 4 | ||||||||||
family | Ornithinimicrobiaceae | 48 | 21 | 1 | 30 | 4 | |||||||||
family | Oscillatoriaceae | 1164 | 155 | 18 | 4 | ||||||||||
family | Oscillochloridaceae | 2 | 1 | ||||||||||||
family | Oscillospiraceae | 2450 | 1538 | 788 | 51 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 27 | 18 | 7 | 3 | 3 |
family | Ostreobiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Oxalobacteraceae | 1517 | 644 | 259 | 12 | 20 | 4 | 25 | 35 | 26 | 8 | 7 | 3 | ||
family | Paenibacillaceae | 1965 | 1333 | 1 | 4 | 26 | 29 | 35 | 5 | 6 | 7 | ||||
family | Palmariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Paludibacteraceae | 9 | 166 | 1 | 2 | 2 | 3 | 33 | 4 | 2 | |||||
family | Parachlamydiaceae | 5 | 5 | 12 | 1 | ||||||||||
family | Parameciidae | 1 | |||||||||||||
family | Parodontellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Parvibaculaceae | 1 | 9 | 13 | 4 | ||||||||||
family | Parvoviridae | 2 | |||||||||||||
family | Parvularculaceae | 32 | 1 | ||||||||||||
family | Pasteurellaceae | 1992 | 1183 | 549 | 14 | 28 | 21 | 29 | 35 | 8 | 12 | 17 | 7 | ||
family | Pasteuriaceae | 97 | 7 | ||||||||||||
family | Patulibacteraceae | 3 | 7 | ||||||||||||
family | Paulinellidae | 1 | |||||||||||||
family | Pectobacteriaceae | 111 | 522 | 2 | 1 | 1 | 1 | 35 | 4 | 3 | |||||
family | Pelagibacteraceae | 6 | 1 | 26 | 1 | ||||||||||
family | Peptococcaceae | 2421 | 1458 | 521 | 28 | 27 | 7 | 24 | 35 | 31 | 9 | 7 | |||
family | Peptoniphilaceae | 2378 | 1443 | 506 | 23 | 33 | 9 | 7 | 35 | 33 | 6 | 8 | 7 | ||
family | Peptostreptococcaceae | 2159 | 1533 | 790 | 48 | 31 | 35 | 30 | 35 | 28 | 13 | 15 | 7 | 1 | 3 |
family | Perlucidibacaceae Liao et al. 2020 | 3 | |||||||||||||
family | Peronosporaceae | 1 | |||||||||||||
family | Persicobacteraceae | 1 | 120 | 1 | 4 | ||||||||||
family | Petrotogaceae | 32 | 47 | 1 | 25 | 4 | 6 | ||||||||
family | Peyssonneliaceae | 1 | |||||||||||||
family | Pezizaceae | 1 | |||||||||||||
family | Phaeodactylaceae | 1 | |||||||||||||
family | Phaffomycetaceae | 1 | |||||||||||||
family | phages with long non-contractile tails | 1 | |||||||||||||
family | Phakopsoraceae | 1 | |||||||||||||
family | Phanerochaetaceae | 1 | |||||||||||||
family | Phreatobacteraceae | 1 | 31 | 1 | |||||||||||
family | Phycisphaeraceae | 2 | 22 | 1 | |||||||||||
family | Phycomycetaceae | 1 | |||||||||||||
family | Phyllobacteriaceae | 73 | 48 | 35 | 5 | 35 | 5 | 1 | |||||||
family | Pirellulaceae Dedysh et al. 2020 | 7 | 58 | 28 | 1 | ||||||||||
family | Piscirickettsiaceae | 323 | 456 | 2 | 3 | 35 | 4 | 1 | |||||||
family | Planctomycetaceae | 17 | 137 | 1 | 35 | 1 | |||||||||
family | Planococcaceae | 1243 | 1313 | 39 | 10 | 40 | 22 | 35 | 19 | 6 | 7 | ||||
family | Plasmodiidae | 4 | 1 | ||||||||||||
family | Plectosphaerellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Pleioneaceae | 4 | |||||||||||||
family | Pleomorphomonadaceae | 8 | 11 | 19 | 1 | ||||||||||
family | Pleosporaceae | 1 | |||||||||||||
family | Polyangiaceae | 101 | 13 | 1 | 1 | 1 | 35 | 4 | |||||||
family | Polyporaceae | 1 | |||||||||||||
family | Porphyromonadaceae | 2432 | 1520 | 525 | 13 | 34 | 25 | 35 | 35 | 27 | 4 | 10 | 7 | 2 | |
family | Porticoccaceae | 2 | |||||||||||||
family | Prevotellaceae | 2405 | 1520 | 570 | 44 | 40 | 18 | 21 | 35 | 35 | 3 | 17 | 7 | 1 | 3 |
family | Prochloraceae | 2 | 2 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
family | Prochlorococcaceae | 1 | |||||||||||||
family | Prochlorotrichaceae | 8 | 15 | 3 | |||||||||||
family | Prolixibacteraceae | 223 | 1 | 4 | 35 | 1 | |||||||||
family | Promicromonosporaceae | 7 | 91 | 33 | 5 | 4 | 1 | ||||||||
family | Propionibacteriaceae | 77 | 718 | 118 | 9 | 4 | 9 | 13 | 35 | 26 | 4 | ||||
family | Proteidae | 5 | 5 | 1 | |||||||||||
family | Proteinivoraceae | 1935 | 661 | 7 | 13 | 7 | |||||||||
family | Pseudanabaenaceae | 694 | 8 | 2 | 11 | 4 | 2 | ||||||||
family | Pseudoalteromonadaceae | 50 | 58 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||||
family | Pseudococcidae | 79 | 2 | 1 | |||||||||||
family | Pseudomonadaceae | 740 | 562 | 51 | 27 | 5 | 2 | 9 | 35 | 34 | 11 | 5 | |||
family | Pseudonocardiaceae | 692 | 488 | 1 | 4 | 35 | 4 | 4 | |||||||
family | Pseudoxanthobacteraceae | 5 | |||||||||||||
family | Psychromonadaceae | 28 | 51 | 10 | 4 | ||||||||||
family | Pucciniaceae | 1 | |||||||||||||
family | Punctulariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Puniceicoccaceae | 1467 | 565 | 7 | 1 | 18 | 15 | 1 | 4 | ||||||
family | Pycnococcaceae | 1 | |||||||||||||
family | Pyrenomonadaceae | 1 | |||||||||||||
family | Pyrinomonadaceae | 49 | |||||||||||||
family | Rarobacteraceae | 80 | |||||||||||||
family | Reichenbachiellaceae | 64 | |||||||||||||
family | Reyranellaceae | 5 | |||||||||||||
family | Rhabditidae | 1 | |||||||||||||
family | Rhabdochlamydiaceae | 196 | |||||||||||||
family | Rhizobiaceae | 690 | 116 | 8 | 9 | 3 | 14 | 35 | 16 | 1 | 7 | ||||
family | Rhizopodaceae | 1 | |||||||||||||
family | Rhodanobacteraceae | 1652 | 267 | 1 | 8 | 35 | 4 | 3 | |||||||
family | Rhodobacteraceae | 517 | 365 | 4 | 1 | 5 | 1 | 4 | 35 | 4 | 1 | 7 | |||
family | Rhodobiaceae | 6 | 18 | 3 | 32 | 4 | |||||||||
family | Rhodocyclaceae | 1495 | 492 | 71 | 1 | 1 | 34 | 1 | 1 | ||||||
family | Rhodomelaceae | 1 | |||||||||||||
family | Rhodospirillaceae | 2019 | 1092 | 371 | 5 | 33 | 25 | 35 | 4 | 22 | 7 | ||||
family | Rhodothalassiaceae | 27 | 16 | 1 | |||||||||||
family | Rhodothermaceae | 2277 | 249 | 2 | 12 | 6 | 35 | 4 | 1 | ||||||
family | Rhodovibrionaceae | 493 | 531 | 13 | 1 | ||||||||||
family | Rickettsiaceae | 1273 | 282 | 1 | 15 | 31 | 4 | 6 | |||||||
family | Rikenellaceae | 60 | 1492 | 735 | 53 | 15 | 36 | 35 | 35 | 35 | 26 | 18 | 7 | 3 | 3 |
family | Rivulariaceae | 1092 | 139 | 3 | 4 | 6 | |||||||||
family | Robiginitomaculaceae | 51 | 2 | ||||||||||||
family | Roseiarcaceae | 5 | |||||||||||||
family | Roseiflexaceae | 2 | 17 | 27 | 1 | ||||||||||
family | Roseivirgaceae | 1 | 67 | 6 | |||||||||||
family | Roseobacteraceae Pujalte et al. 2014 | 147 | 95 | 1 | 1 | 35 | 4 | 2 | |||||||
family | Ruaniaceae | 1 | 27 | ||||||||||||
family | Rubricoccaceae | 13 | |||||||||||||
family | Rubritaleaceae | 826 | 228 | 9 | 8 | ||||||||||
family | Rubrobacteraceae | 30 | 111 | 3 | 7 | 34 | 3 | ||||||||
family | Ruminococcaceae | 2450 | 1538 | 788 | 3 | 40 | 28 | 36 | 4 | 28 | 18 | 7 | 2 | ||
family | Saccharomycetaceae | 13 | 9 | 5 | |||||||||||
family | Saccharospirillaceae | 63 | 529 | 1 | 26 | 1 | |||||||||
family | Salinibacteraceae | 4 | |||||||||||||
family | Salinisphaeraceae | 24 | 7 | 1 | |||||||||||
family | Salinivirgaceae | 13 | 1 | ||||||||||||
family | Salisaetaceae | 452 | 221 | 1 | 4 | ||||||||||
family | Salpingoecidae | 1 | |||||||||||||
family | Sandaracinaceae | 18 | 16 | 1 | |||||||||||
family | Sanguibacteraceae | 9 | 5 | 24 | 1 | 1 | |||||||||
family | Saprospiraceae | 101 | 96 | 28 | 1 | ||||||||||
family | Sarcocystidae | 1 | |||||||||||||
family | Schistosomatidae | 1 | |||||||||||||
family | Schleiferiaceae | 35 | 14 | 1 | |||||||||||
family | Sclerotiniaceae | 1 | |||||||||||||
family | Scolopacidae | 16 | |||||||||||||
family | Scytonemataceae | 28 | 4 | 4 | |||||||||||
family | Sedimentisphaeraceae | 1 | 27 | 3 | |||||||||||
family | Segniliparaceae | 52 | 2 | 12 | 1 | ||||||||||
family | Selenastraceae | 1 | |||||||||||||
family | Selenomonadaceae | 2422 | 870 | 98 | 16 | 29 | 5 | 12 | 35 | 34 | 1 | 7 | |||
family | Shewanellaceae | 1525 | 190 | 28 | 16 | 35 | 32 | 5 | |||||||
family | Silvanigrellaceae | 3 | |||||||||||||
family | Simkaniaceae | 12 | 3 | 1 | |||||||||||
family | Sinobacteraceae | 1849 | 186 | 2 | 1 | 19 | 34 | 1 | |||||||
family | Sneathiellaceae | 13 | |||||||||||||
family | Solanaceae | 11 | |||||||||||||
family | Solibacteraceae | 6 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Solirubrobacteraceae | 23 | 28 | ||||||||||||
family | Sordariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Sphaerobacteraceae | 30 | 1 | 26 | |||||||||||
family | Sphaerochaetaceae | 4 | 2 | 1 | 34 | 1 | |||||||||
family | Sphingobacteriaceae | 2443 | 797 | 4 | 5 | 39 | 24 | 35 | 4 | 4 | 7 | ||||
family | Sphingomonadaceae | 926 | 778 | 17 | 2 | 16 | 14 | 35 | 4 | 1 | 6 | ||||
family | Sphingosinicellaceae | 20 | 1 | 17 | 4 | ||||||||||
family | Spirillaceae | 5 | 14 | ||||||||||||
family | Spirochaetaceae | 582 | 177 | 1 | 3 | 35 | 4 | 1 | |||||||
family | Spiroplasmataceae | 573 | 1 | 6 | 34 | 5 | |||||||||
family | Spirosomaceae | 1980 | 906 | 3 | 11 | 2 | 34 | 4 | 6 | ||||||
family | Spirulinaceae | 12 | |||||||||||||
family | Spongiibacteraceae | 248 | 1 | 14 | 1 | ||||||||||
family | Sporichthyaceae | 12 | 22 | 18 | |||||||||||
family | Sporolactobacillaceae | 723 | 230 | 2 | 33 | 1 | 1 | ||||||||
family | Sporomusaceae | 1667 | 1075 | 34 | 3 | 5 | 35 | 4 | 7 | ||||||
family | Staphylinidae | 5 | 3 | ||||||||||||
family | Staphylococcaceae | 1849 | 449 | 207 | 32 | 17 | 3 | 3 | 35 | 35 | 6 | 5 | 5 | ||
family | Stappiaceae | 4 | 1 | 35 | 4 | ||||||||||
family | Stellaceae | 292 | 2 | 34 | |||||||||||
family | Stereaceae | 1 | |||||||||||||
family | Steroidobacteraceae | 27 | 45 | 17 | |||||||||||
family | Sterolibacteriaceae | 387 | 69 | 11 | 1 | 2 | 35 | 4 | |||||||
family | Streptococcaceae | 2428 | 1535 | 776 | 39 | 40 | 36 | 36 | 35 | 35 | 24 | 16 | 7 | 2 | 3 |
family | Streptomycetaceae | 476 | 390 | 9 | 2 | 35 | 35 | 2 | 6 | ||||||
family | Streptosporangiaceae | 1021 | 228 | 1 | 11 | 35 | 2 | 2 | |||||||
family | Strongyloididae | 1 | |||||||||||||
family | Stylonemataceae | 1 | |||||||||||||
family | Succinivibrionaceae | 688 | 338 | 15 | 9 | 2 | 2 | 34 | 21 | 3 | |||||
family | Suillaceae | 1 | |||||||||||||
family | Sulfolobaceae | 5 | 1 | ||||||||||||
family | Sulfuricellaceae Watanabe et al. 2014 | 6 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
family | Sulfurovaceae Waite et al. 2017 | 5 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
family | Sutterellaceae | 2406 | 1473 | 713 | 21 | 40 | 33 | 36 | 34 | 3 | 23 | 18 | 7 | 1 | 3 |
family | Symbiobacteriaceae | 1551 | 423 | 3 | 7 | 35 | 3 | ||||||||
family | Synchytriaceae | 1 | |||||||||||||
family | Synechococcaceae | 697 | 13 | 1 | 1 | 35 | 5 | ||||||||
family | Synergistaceae | 1819 | 603 | 236 | 3 | 20 | 3 | 1 | 35 | 10 | 2 | 1 | 7 | 1 | |
family | Syntrophaceae | 327 | 82 | 1 | 1 | 30 | 4 | 1 | |||||||
family | Syntrophobacteraceae | 742 | 474 | 2 | 20 | 30 | 1 | 2 | |||||||
family | Syntrophomonadaceae | 2046 | 747 | 11 | 3 | 4 | 33 | 4 | 5 | ||||||
family | Syntrophorhabdaceae | 31 | 1 | ||||||||||||
family | Syntrophotaleaceae | 44 | 3 | 27 | 2 | ||||||||||
family | Tannerellaceae | 2423 | 1486 | 720 | 46 | 34 | 37 | 34 | 35 | 35 | 22 | 18 | 7 | 2 | 3 |
family | Taphrinaceae | 1 | |||||||||||||
family | Temperatibacteraceae | 1 | |||||||||||||
family | Tenuifilaceae Podosokorskaya et al. 2020 | 27 | |||||||||||||
family | Tepidamorphaceae | 6 | |||||||||||||
family | Tepidanaerobacteraceae | 875 | 17 | 1 | 33 | 2 | 2 | ||||||||
family | Tepidiformaceae | 18 | |||||||||||||
family | Tepidimicrobiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Terasakiellaceae | 6 | 9 | 1 | |||||||||||
family | Terrimicrobiaceae | 4 | |||||||||||||
family | Thalassobaculaceae | 113 | 3 | 7 | |||||||||||
family | Thalassospiraceae | 553 | 54 | 359 | 6 | 26 | 1 | ||||||||
family | Thermaceae | 853 | 88 | 1 | 1 | 3 | 35 | 5 | 5 | ||||||
family | Thermoactinomycetaceae | 1585 | 831 | 1 | 4 | 9 | 35 | 4 | 6 | ||||||
family | Thermoanaerobacteraceae | 2114 | 459 | 213 | 4 | 29 | 35 | 5 | 4 | ||||||
family | Thermoanaerobacterales Family III. Incertae Sedis | 2371 | 236 | 23 | 32 | 1 | 35 | 31 | 7 | ||||||
family | Thermoanaerobacterales Family IV. Incertae Sedis | 40 | 1 | 27 | |||||||||||
family | Thermoanaerobaculaceae | 101 | |||||||||||||
family | Thermococcaceae | 4 | 1 | 5 | 3 | ||||||||||
family | Thermodesulfobacteriaceae | 207 | 89 | 1 | 29 | 1 | 2 | ||||||||
family | Thermodesulfobiaceae | 24 | 124 | 17 | 2 | 2 | 5 | 6 | 1 | ||||||
family | Thermodesulfovibrionaceae | 556 | 21 | 1 | 13 | 3 | 6 | ||||||||
family | Thermoflexaceae | 4 | |||||||||||||
family | Thermoflexibacteraceae | 127 | |||||||||||||
family | Thermogemmatisporaceae | 261 | 7 | 1 | 25 | 3 | |||||||||
family | Thermoguttaceae Dedysh et al. 2020 | 44 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Thermohalobacteraceae Spring 2020 | 1254 | 4 | 8 | 4 | 33 | |||||||||
family | Thermoleophilaceae | 74 | 1 | ||||||||||||
family | Thermolithobacteraceae | 72 | |||||||||||||
family | Thermomicrobiaceae | 3 | 1 | ||||||||||||
family | Thermomonosporaceae | 774 | 89 | 1 | 9 | 35 | 4 | 3 | |||||||
family | Thermonemataceae | 51 | 4 | ||||||||||||
family | Thermoplasmataceae | 1 | |||||||||||||
family | Thermoproteaceae | 2 | |||||||||||||
family | Thermosediminibacteraceae | 147 | 75 | 5 | 21 | 1 | 6 | ||||||||
family | Thermosporotrichaceae | 23 | 12 | ||||||||||||
family | Thermosynechococcaceae | 15 | 2 | ||||||||||||
family | Thermotogaceae | 79 | 2 | 1 | 28 | 4 | 6 | ||||||||
family | Thermotomaculaceae | 18 | 1 | ||||||||||||
family | Thioalkalibacteraceae | 28 | 1 | 18 | |||||||||||
family | Thioalkalispiraceae | 69 | 1 | 29 | 3 | ||||||||||
family | Thiobacillaceae | 418 | 63 | 6 | 1 | 31 | 1 | 1 | |||||||
family | Thiofilaceae | 5 | |||||||||||||
family | Thiolinaceae | 2 | |||||||||||||
family | Thioprofundaceae | 12 | |||||||||||||
family | Thiotrichaceae | 1714 | 109 | 1 | 23 | 25 | 1 | 3 | 3 | ||||||
family | Thiovulaceae Waite et al. 2017 | 15 | 12 | 1 | 33 | 3 | |||||||||
family | Thorselliaceae | 77 | |||||||||||||
family | Tissierellaceae | 125 | 787 | 1 | 25 | 10 | 2 | 2 | 35 | 28 | 3 | ||||
family | Trebouxiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Treponemataceae | 579 | 83 | 27 | 6 | 35 | 28 | 1 | |||||||
family | Trichocoleusaceae | 3 | |||||||||||||
family | Trichocomaceae | 1 | 1 | ||||||||||||
family | Trichomonadidae | 1 | |||||||||||||
family | Trichomonascaceae | 1 | |||||||||||||
family | Trichosporonaceae | 1 | |||||||||||||
family | Trichostrongylidae | 1 | |||||||||||||
family | Tropherymataceae | 92 | 1 | ||||||||||||
family | Trueperaceae | 28 | 21 | ||||||||||||
family | Trypanosomatidae | 1 | |||||||||||||
family | Tsukamurellaceae | 140 | 11 | 28 | 4 | 1 | |||||||||
family | Tuberaceae | 1 | |||||||||||||
family | Tulasnellaceae | 1 | |||||||||||||
family | Turicibacteraceae Verbarg et al. 2014 | 1633 | 963 | 476 | 6 | 22 | 19 | 8 | 35 | 5 | 3 | 11 | 5 | ||
family | Ulvaceae | 1 | |||||||||||||
family | unclassified Actinobacteria (class) (miscellaneous) | 4 | 1 | ||||||||||||
family | unclassified Bacillales | 19 | 40 | ||||||||||||
family | unclassified Burkholderiales | 200 | 198 | 18 | 15 | 13 | 4 | 3 | 3 | ||||||
family | unclassified Clostridiales | 716 | 783 | 9 | 8 | 34 | 35 | 2 | 5 | 3 | 1 | 1 | |||
family | unclassified Rickettsiales | 4 | |||||||||||||
family | Unionidae | 325 | 1 | ||||||||||||
family | Uronemataceae | 1 | |||||||||||||
family | Ustilaginaceae | 8 | 1 | ||||||||||||
family | Vacuolariaceae | 1 | |||||||||||||
family | Vallitaleaceae Quemeneur et al. | 104 | 4 | 14 | 3 | 34 | 2 | ||||||||
family | Veillonellaceae | 2449 | 1531 | 744 | 22 | 32 | 32 | 32 | 35 | 34 | 14 | 16 | 7 | 3 | |
family | Verrucomicrobia subdivision 3 | 24 | 31 | 2 | |||||||||||
family | Verrucomicrobiaceae | 2095 | 283 | 221 | 3 | 8 | 33 | 1 | 1 | 3 | |||||
family | Vibrionaceae | 157 | 147 | 7 | 35 | 4 | 4 | ||||||||
family | Vicinamibacteraceae | 28 | 1 | ||||||||||||
family | Victivallaceae | 399 | 285 | 2 | 6 | 6 | 6 | 5 | |||||||
family | Viviparidae | 145 | 1 | 1 | |||||||||||
family | Volvocaceae | 1 | |||||||||||||
family | Vulgatibacteraceae | 22 | |||||||||||||
family | Waddliaceae | 20 | 1 | ||||||||||||
family | Wallemiaceae | 1 | |||||||||||||
family | Weeksellaceae | 191 | 142 | 9 | 1 | 1 | 35 | 4 | 2 | 6 | |||||
family | Wenzhouxiangellaceae | 54 | 6 | 1 | |||||||||||
family | Woeseiaceae | 7 | 1 | ||||||||||||
family | Xanthobacteraceae | 46 | 21 | 1 | 1 | 34 | 1 | 6 | |||||||
family | Xanthomonadaceae | 1994 | 408 | 19 | 4 | 16 | 35 | 4 | 1 | 7 | 6 | ||||
family | Xenococcaceae | 5 | |||||||||||||
family | Yersiniaceae | 1851 | 221 | 20 | 28 | 16 | 2 | 6 | 35 | 24 | 13 | ||||
family | Zoogloeaceae | 611 | 196 | 1 | 1 | 3 | 1 | 35 | 4 | 2 | 3 | ||||
family | Zymomonadaceae | 1 | 1 | 8 | 29 | 14 | |||||||||
forma | Volvox carteri f. nagariensis | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Acyrthosiphon kondoi) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Acyrthosiphon pisum) | 2 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Aphis glycines) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Cinara cedri) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Cinara confinis) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Cinara pseudotaxifoliae) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Diuraphis noxia) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Myzus persicae) | 4 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Schizaphis graminum) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Schlechtendalia chinensis) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Tuberolachnus salignus) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Buchnera aphidicola (Uroleucon ambrosiae) | 1 | |||||||||||||
forma specialis | cyanobacterium endosymbiont of Epithemia turgida isolate EtSB Lake Yunoko | 1 | |||||||||||||
forma specialis | endosymbiont of Bathymodiolus septemdierum str. Myojin knoll | 1 | |||||||||||||
forma specialis | primary endosymbiont of Heteropsylla cubana | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis | 1 | |||||||||||||
forma specialis | Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina morsitans | 4 | |||||||||||||
forma specialis | Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina morsitans morsitans (Yale colony) | 3 | |||||||||||||
genus | 'Grimontella' | 1 | |||||||||||||
genus | 'Haloanella' | 2 | |||||||||||||
genus | 'Kouleothrix' | 2 | |||||||||||||
genus | 'Terrahaemophilus' | 1 | |||||||||||||
genus | Abiotrophia | 148 | 180 | 9 | 2 | 2 | 3 | 26 | |||||||
genus | Absiella | 397 | 516 | 1 | 6 | 13 | 1 | ||||||||
genus | Abyssicoccus | 14 | |||||||||||||
genus | Abyssivirga | 1 | |||||||||||||
genus | Acanthamoeba | 1 | |||||||||||||
genus | Acanthopleuribacter | 61 | |||||||||||||
genus | Acaryochloris | 3 | 4 | ||||||||||||
genus | Accumulibacter | 31 | 3 | ||||||||||||
genus | Acetanaerobacterium | 767 | 123 | 3 | 9 | 1 | |||||||||
genus | Acetatifactor | 1415 | 2 | 8 | 9 | 1 | |||||||||
genus | Acetilactobacillus | 8 | 3 | ||||||||||||
genus | Acetitomaculum | 1073 | 138 | 3 | 3 | 1 | |||||||||
genus | Acetivibrio | 2414 | 1436 | 32 | 9 | 14 | 2 | 26 | 35 | 5 | 7 | ||||
genus | Acetoanaerobium | 854 | 4 | 12 | 35 | 2 | |||||||||
genus | Acetobacter | 20 | 23 | 1 | 1 | 35 | 3 | 2 | |||||||
genus | Acetobacterium | 2405 | 676 | 4 | 36 | 2 | 35 | 4 | 7 | ||||||
genus | Acetobacteroides | 362 | |||||||||||||
genus | Acetohalobium | 52 | 5 | 1 | 26 | 2 | |||||||||
genus | Acetomicrobium | 26 | 55 | 1 | |||||||||||
genus | Acetonema | 366 | 2 | 2 | |||||||||||
genus | Acholeplasma | 1716 | 1052 | 6 | 2 | 6 | 1 | 35 | 5 | 3 | |||||
genus | Achromatium | 29 | |||||||||||||
genus | Achromobacter | 191 | 1 | 1 | 2 | 9 | 35 | 4 | 2 | ||||||
genus | Acidaminobacter | 588 | 496 | 3 | 6 | 3 | |||||||||
genus | Acidaminococcus | 1754 | 795 | 96 | 13 | 14 | 1 | 4 | 35 | 28 | 1 | 5 | 3 | ||
genus | Acidianus | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Acidibacter | 47 | |||||||||||||
genus | Acidibrevibacterium | 3 | 1 | ||||||||||||
genus | Acidicaldus | 3 | |||||||||||||
genus | Acidicapsa | 81 | 1 | ||||||||||||
genus | Acidiferrobacter | 11 | 4 | 3 | |||||||||||
genus | Acidihalobacter | 1 | 33 | 1 | |||||||||||
genus | Acidimicrobium | 294 | 3 | 2 | 1 | 1 | |||||||||
genus | Acidiphilium | 53 | 3 | 14 | 1 | 1 | 1 | ||||||||
genus | Acidipropionibacterium | 25 | 1 | 5 | 34 | 13 | |||||||||
genus | Acidisarcina Belova et al. 2018 | 5 | |||||||||||||
genus | Acidisoma | 11 | |||||||||||||
genus | Acidisphaera | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Aciditerrimonas | 264 | 2 | ||||||||||||
genus | Acidithiobacillus | 45 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
genus | Acidobacterium | 1 | 22 | 3 | |||||||||||
genus | Acidocella | 6 | 3 | ||||||||||||
genus | Acidothermus | 66 | 4 | 1 | |||||||||||
genus | Acidovorax | 124 | 43 | 1 | 1 | 1 | 35 | 4 | 1 | 4 | |||||
genus | Acinetobacter | 522 | 358 | 16 | 21 | 1 | 4 | 6 | 35 | 34 | 15 | 5 | 4 | ||
genus | Acrocarpospora | 4 | |||||||||||||
genus | Actibacter | 1 | |||||||||||||
genus | Actibacterium | 5 | 1 | ||||||||||||
genus | Actimicrobium | 7 | |||||||||||||
genus | Actinoallomurus | 3 | 1 | ||||||||||||
genus | Actinoalloteichus | 2 | 25 | 4 | |||||||||||
genus | Actinobacillus | 1361 | 354 | 90 | 4 | 13 | 7 | 33 | 4 | 5 | |||||
genus | Actinobaculum | 184 | 11 | 17 | 7 | 20 | 1 | 2 | |||||||
genus | Actinocatenispora | 671 | 179 | 3 | |||||||||||
genus | Actinocorallia | 4 | 4 | 2 | |||||||||||
genus | Actinokineospora | 5 | 3 | ||||||||||||
genus | Actinomadura | 55 | 51 | 1 | 32 | 1 | 2 | ||||||||
genus | Actinomyces | 1779 | 1217 | 580 | 5 | 15 | 29 | 10 | 35 | 5 | 5 | 7 | |||
genus | Actinomycetospora | 13 | 2 | ||||||||||||
genus | Actinoplanes | 24 | 130 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
genus | Actinopolymorpha | 152 | 2 | 8 | 1 | ||||||||||
genus | Actinopolyspora | 525 | 264 | 6 | 20 | 1 | |||||||||
genus | Actinorugispora | 1 | |||||||||||||
genus | Actinosynnema | 11 | 1 | ||||||||||||
genus | Actinotalea | 2 | 9 | ||||||||||||
genus | Actinotignum | 37 | 95 | 29 | 3 | 28 | |||||||||
genus | Acutalibacter | 14 | |||||||||||||
genus | Adhaeribacter | 12 | 41 | 7 | |||||||||||
genus | Adlercreutzia | 1811 | 538 | 19 | 17 | 28 | 5 | 35 | 31 | 1 | 6 | 6 | |||
genus | Advenella | 8 | 1 | 26 | 3 | ||||||||||
genus | Aequorivita | 3 | 9 | 2 | 12 | 1 | |||||||||
genus | Aeribacillus | 31 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Aeriscardovia | 226 | |||||||||||||
genus | Aerococcus | 36 | 463 | 16 | 1 | 7 | 35 | 4 | |||||||
genus | Aeromicrobium | 30 | 3 | 1 | 33 | 1 | 3 | ||||||||
genus | Aeromonas | 176 | 7 | 1 | 1 | 4 | 35 | 4 | |||||||
genus | Aerosphaera | 48 | |||||||||||||
genus | Aerosticca Watanabe et al. 2020 | 6 | 3 | ||||||||||||
genus | Aestuariibacter | 2 | |||||||||||||
genus | Aestuariicola | 3 | |||||||||||||
genus | Aestuariispira | 602 | 2 | ||||||||||||
genus | Afifella | 2 | |||||||||||||
genus | Afipia | 6 | 1 | 5 | 3 | ||||||||||
genus | Agaribacter | 343 | |||||||||||||
genus | Agarilytica | 1 | |||||||||||||
genus | Agarivorans | 23 | 1 | ||||||||||||
genus | Agathobacter | 1 | 8 | 1 | |||||||||||
genus | Agathobaculum | 1505 | 1 | 14 | 15 | 32 | 8 | ||||||||
genus | Aggregatibacter | 634 | 261 | 172 | 6 | 14 | 3 | 2 | 33 | 1 | 1 | 5 | |||
genus | Aggregicoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Agreia | 2 | |||||||||||||
genus | Agrilactobacillus | 176 | 3 | ||||||||||||
genus | Agrobacterium | 108 | 1 | 35 | 4 | ||||||||||
genus | Agrococcus | 50 | 2 | 3 | 1 | 25 | 1 | ||||||||
genus | Agromyces | 428 | 184 | 1 | 2 | 30 | 1 | 1 | |||||||
genus | Ahniella | 1 | |||||||||||||
genus | Ahrensia | 1 | |||||||||||||
genus | Akkermansia | 2092 | 1297 | 790 | 26 | 15 | 34 | 36 | 35 | 34 | 19 | 18 | 4 | 2 | 3 |
genus | Albibacterium | 1 | |||||||||||||
genus | Albidovulum | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Albimonas | 9 | |||||||||||||
genus | Albugo | 1 | |||||||||||||
genus | Alca | 11 | |||||||||||||
genus | Alcaligenes | 15 | 2 | 1 | 33 | 3 | |||||||||
genus | Alcanivorax | 309 | 12 | 1 | 35 | 1 | |||||||||
genus | Algibacter | 1 | 3 | 13 | 1 | ||||||||||
genus | Algicola | 56 | |||||||||||||
genus | Algimonas | 17 | 2 | ||||||||||||
genus | Algiphilus | 48 | |||||||||||||
genus | Algivirga | 4 | |||||||||||||
genus | Algorimarina | 2 | |||||||||||||
genus | Algoriphagus | 135 | 1 | 18 | 3 | ||||||||||
genus | Aliarcobacter | 84 | 4 | 1 | 6 | 4 | 1 | ||||||||
genus | Alicycliphilus | 11 | 5 | 15 | 1 | 3 | |||||||||
genus | Alicyclobacillus | 6 | 222 | 3 | 4 | 3 | 32 | 3 | |||||||
genus | Alienimonas Boersma et al. 2020 | 11 | |||||||||||||
genus | Aliicoccus | 3 | |||||||||||||
genus | Aliidiomarina | 26 | |||||||||||||
genus | Aliifodinibius | 255 | |||||||||||||
genus | Aliihoeflea | 1 | |||||||||||||
genus | Aliivibrio | 1 | 16 | 1 | |||||||||||
genus | Alishewanella | 438 | 80 | 2 | 2 | ||||||||||
genus | Alistipes | 1490 | 735 | 52 | 15 | 36 | 33 | 35 | 35 | 26 | 11 | 7 | 3 | 3 | |
genus | Alkalibacillus | 178 | 5 | ||||||||||||
genus | Alkalibacter | 158 | 2 | 3 | |||||||||||
genus | Alkalibacterium | 821 | 9 | 1 | 4 | 1 | 7 | ||||||||
genus | Alkalibaculum | 384 | 1 | 2 | |||||||||||
genus | Alkalicoccus | 56 | |||||||||||||
genus | Alkaliflexus | 77 | 3 | ||||||||||||
genus | Alkalihalobacillus | 33 | 52 | 8 | 1 | 35 | 6 | ||||||||
genus | Alkalilimnicola | 25 | 1 | ||||||||||||
genus | Alkalimarinus | 17 | |||||||||||||
genus | Alkalimicrobium | 5 | |||||||||||||
genus | Alkaliphilus | 2393 | 456 | 7 | 24 | 4 | 35 | 5 | 7 | ||||||
genus | Alkalispirillum | 1 | |||||||||||||
genus | Alkalispirochaeta | 1 | |||||||||||||
genus | Alkalitalea | 28 | 1 | ||||||||||||
genus | Alkanibacter | 1 | |||||||||||||
genus | Alkanindiges | 17 | 3 | ||||||||||||
genus | Allisonella | 294 | 68 | 5 | 2 | 3 | |||||||||
genus | Alloactinosynnema | 12 | 4 | ||||||||||||
genus | Allobacillus | 2 | |||||||||||||
genus | Allobaculum | 184 | 245 | 8 | 2 | 2 | |||||||||
genus | Allocatelliglobosispora | 2 | |||||||||||||
genus | Allochromatium | 120 | 16 | 1 | |||||||||||
genus | Allofrancisella | 6 | 4 | 1 | |||||||||||
genus | Allofustis | 28 | 2 | 2 | |||||||||||
genus | Allohahella | 287 | 119 | 2 | |||||||||||
genus | Alloiococcus | 4 | 131 | 1 | |||||||||||
genus | Allokutzneria | 1 | 17 | 1 | |||||||||||
genus | Allomeiothermus | 1 | |||||||||||||
genus | Alloprevotella | 14 | 631 | 83 | 7 | 1 | 2 | 35 | 1 | ||||||
genus | Allopseudarcicella | 3 | |||||||||||||
genus | Alloscardovia | 161 | 236 | 19 | 2 | 4 | |||||||||
genus | Allosphingosinicella | 15 | 3 | ||||||||||||
genus | Alsobacter | 2 | |||||||||||||
genus | Alteracholeplasma | 45 | 69 | 1 | 12 | 1 | 1 | ||||||||
genus | Altererythrobacter | 23 | 2 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
genus | Alteribacillus | 6 | |||||||||||||
genus | Alteribacter | 15 | |||||||||||||
genus | Alterileibacterium | 11 | 2 | ||||||||||||
genus | Alternaria | 1 | |||||||||||||
genus | Alterococcus | 33 | 1 | ||||||||||||
genus | Alteromonas | 1 | 36 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
genus | Altibacter | 3 | |||||||||||||
genus | Alysiella | 4 | |||||||||||||
genus | Amaricoccus | 100 | 3 | 2 | |||||||||||
genus | Amedibacillus | 1655 | 563 | 1 | 6 | 12 | 1 | 3 | 2 | ||||||
genus | Amedibacterium | 1 | 35 | 1 | |||||||||||
genus | Aminicella | 967 | 1 | ||||||||||||
genus | Aminiphilus | 262 | 5 | 5 | |||||||||||
genus | Aminipila | 1 | 1 | 35 | 5 | ||||||||||
genus | Aminivibrio | 78 | |||||||||||||
genus | Aminobacter | 23 | 1 | 4 | 25 | 2 | |||||||||
genus | Aminobacterium | 115 | 26 | 4 | 7 | 1 | |||||||||
genus | Aminomonas | 71 | 4 | ||||||||||||
genus | Ammonifex | 869 | 7 | 1 | 21 | ||||||||||
genus | Ammoniphilus | 100 | 58 | ||||||||||||
genus | Amoebophilus | 2232 | 3 | 1 | 2 | 1 | 5 | ||||||||
genus | Amphibacillus | 50 | 21 | 4 | |||||||||||
genus | Amphritea | 61 | 5 | ||||||||||||
genus | Amycolatopsis | 36 | 7 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||||
genus | Amylibacter | 5 | |||||||||||||
genus | Amylolactobacillus | 2 | |||||||||||||
genus | Anabaena | 2 | 3 | ||||||||||||
genus | Anabaenopsis | 1 | |||||||||||||
genus | Anaerobacillus | 567 | 3 | 20 | |||||||||||
genus | Anaerobacter | 59 | |||||||||||||
genus | Anaerobacterium | 55 | 47 | 1 | 4 | 3 | |||||||||
genus | Anaerobiospirillum | 16 | 46 | 2 | 10 | ||||||||||
genus | Anaerobium | 484 | 1 | 14 | 19 | ||||||||||
genus | Anaerobranca | 1937 | 634 | 5 | 11 | 7 | |||||||||
genus | Anaerobutyricum | 1457 | 1 | 20 | 14 | 32 | 32 | 35 | 23 | 22 | |||||
genus | Anaerocella | 198 | |||||||||||||
genus | Anaerococcus | 1096 | 883 | 374 | 5 | 17 | 1 | 5 | 35 | 5 | 3 | 5 | |||
genus | Anaerocolumna | 1281 | 33 | 10 | 8 | 35 | 15 | ||||||||
genus | Anaerofilum | 2414 | 884 | 249 | 2 | 40 | 5 | 8 | 7 | ||||||
genus | Anaerofustis | 601 | 1041 | 205 | 11 | 9 | |||||||||
genus | Anaeroglobus | 854 | 14 | 11 | |||||||||||
genus | Anaerohalosphaera | 13 | |||||||||||||
genus | Anaerolinea | 196 | 116 | 4 | 1 | 2 | 10 | 1 | |||||||
genus | Anaeromassilibacillus | 1 | 11 | 9 | 4 | ||||||||||
genus | Anaeromicropila | 1 | |||||||||||||
genus | Anaeromusa | 216 | 29 | 2 | |||||||||||
genus | Anaeromyxobacter | 1 | 683 | 1 | 1 | 35 | 1 | ||||||||
genus | Anaerophaga | 18 | 1 | ||||||||||||
genus | Anaeroplasma | 274 | 221 | 48 | 9 | 1 | 2 | ||||||||
genus | Anaerorhabdus | 38 | |||||||||||||
genus | Anaerosacchariphilus | 1 | 13 | ||||||||||||
genus | Anaerosalibacter | 355 | 5 | ||||||||||||
genus | Anaerosinus | 70 | 34 | 2 | |||||||||||
genus | Anaerosphaera | 152 | 2 | 5 | |||||||||||
genus | Anaerospora | 4 | 301 | ||||||||||||
genus | Anaerosporobacter | 854 | 552 | 1 | 1 | 5 | |||||||||
genus | Anaerostipes | 2171 | 1527 | 780 | 29 | 40 | 37 | 36 | 35 | 35 | 25 | 12 | 7 | 1 | |
genus | Anaerotaenia | 1 | 3 | ||||||||||||
genus | Anaerotignum | 1464 | 10 | 15 | 7 | 21 | 35 | 4 | 4 | ||||||
genus | Anaerotruncus | 2362 | 1260 | 732 | 18 | 24 | 22 | 29 | 1 | 2 | 7 | 7 | 1 | 3 | |
genus | Anaerovibrio | 2213 | 24 | 9 | 3 | 10 | 1 | 1 | |||||||
genus | Anaerovirgula | 1 | |||||||||||||
genus | Anaerovorax | 98 | 277 | 1 | 3 | 13 | |||||||||
genus | Anaplasma | 10 | 4 | 1 | |||||||||||
genus | Ancylobacter | 14 | 15 | ||||||||||||
genus | Anderseniella | 1 | 5 | 4 | |||||||||||
genus | Andreesenia | 29 | |||||||||||||
genus | Andreprevotia | 1 | |||||||||||||
genus | Aneurinibacillus | 6 | 78 | 1 | 31 | 2 | |||||||||
genus | Angelakisella | 7 | 21 | ||||||||||||
genus | Annandia | 2 | |||||||||||||
genus | Annwoodia | 1 | |||||||||||||
genus | Anoxybacillus | 175 | 60 | 3 | 1 | 1 | 32 | 1 | 1 | 1 | |||||
genus | Anoxybacter | 1 | 6 | 30 | 4 | ||||||||||
genus | Anoxynatronum | 933 | 3 | ||||||||||||
genus | Anseongella | 1 | 21 | ||||||||||||
genus | Antarcticibacterium | 17 | |||||||||||||
genus | Antarctobacter | 6 | 1 | ||||||||||||
genus | Anthracocystis | 1 | |||||||||||||
genus | Apibacter | 1 | 27 | 1 | |||||||||||
genus | Apilactobacillus | 14 | 5 | 3 | |||||||||||
genus | Apiotrichum | 1 | |||||||||||||
genus | Aquabacterium | 11 | 82 | 5 | 1 | 17 | 1 | ||||||||
genus | Aquamicrobium | 21 | |||||||||||||
genus | Aquaspirillum | 51 | 19 | ||||||||||||
genus | Aquibacter | 9 | 1 | ||||||||||||
genus | Aquicella | 5 | 11 | 8 | |||||||||||
genus | Aquiflexum | 11 | 6 | 1 | |||||||||||
genus | Aquihabitans | 24 | |||||||||||||
genus | Aquiluna | 4 | 15 | ||||||||||||
genus | Aquimarina | 8 | 49 | 1 | 29 | 4 | |||||||||
genus | Aquimonas | 17 | 20 | ||||||||||||
genus | Aquincola | 9 | |||||||||||||
genus | Aquipuribacter | 6 | |||||||||||||
genus | Aquirhabdus | 1 | |||||||||||||
genus | Aquisalibacillus | 3 | |||||||||||||
genus | Aquisalimonas | 73 | |||||||||||||
genus | Aquisphaera | 2 | 23 | ||||||||||||
genus | Aquitalea | 25 | 7 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
genus | Arabia | 1 | 1 | 1 | 35 | 1 | |||||||||
genus | Arachidicoccus | 1 | 32 | 3 | |||||||||||
genus | Arachnia | 1 | 1 | 1 | 2 | 33 | |||||||||
genus | Arcanobacterium | 94 | 41 | 31 | 1 | 1 | 34 | 2 | |||||||
genus | Archaeoglobus | 3 | 4 | 2 | |||||||||||
genus | Archangium | 12 | 22 | 1 | |||||||||||
genus | Arcicella | 2 | 134 | 2 | |||||||||||
genus | Arcobacter | 135 | 22 | 1 | 1 | 34 | 4 | 1 | |||||||
genus | Arcobacter group | 79 | 19 | 1 | 1 | 32 | 4 | 1 | |||||||
genus | Arcticibacterium | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Ardenticatena | 29 | 2 | ||||||||||||
genus | Arenibacter | 4 | 2 | 3 | 3 | ||||||||||
genus | Arenimonas | 10 | 41 | 2 | |||||||||||
genus | Arhodomonas | 16 | |||||||||||||
genus | Aridibacter | 21 | |||||||||||||
genus | Armatimonas | 2 | 1 | ||||||||||||
genus | Aromatoleum | 16 | 1 | ||||||||||||
genus | Arsenicicoccus | 5 | 8 | 13 | 1 | ||||||||||
genus | Arsenophonus | 43 | 33 | 12 | 1 | ||||||||||
genus | Arthrobacter | 286 | 11 | 10 | 1 | 2 | 1 | 35 | 5 | 2 | 1 | ||||
genus | Arthromitus | 1 | 31 | 4 | |||||||||||
genus | Arthronema | 12 | 1 | ||||||||||||
genus | Arthrospira | 29 | 8 | 1 | 3 | 1 | 1 | ||||||||
genus | Asaccharobacter | 11 | 1 | 7 | |||||||||||
genus | Asaccharospora | 99 | 1 | ||||||||||||
genus | Asaia | 4 | 11 | 1 | |||||||||||
genus | Asinibacterium | 11 | |||||||||||||
genus | Aspergillus | 9 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Asteroleplasma | 419 | 73 | 3 | 1 | ||||||||||
genus | Asticcacaulis | 891 | 86 | 15 | 20 | 1 | 1 | ||||||||
genus | Atelocyanobacterium | 1 | |||||||||||||
genus | Atlantibacter | 8 | 1 | ||||||||||||
genus | Atopobacter | 10 | |||||||||||||
genus | Atopobium | 839 | 604 | 98 | 5 | 3 | 3 | 10 | 1 | 3 | |||||
genus | Atopococcus | 27 | |||||||||||||
genus | Atopomonas | 6 | |||||||||||||
genus | Atopostipes | 108 | 2 | ||||||||||||
genus | Aurantiacibacter | 21 | 8 | 1 | |||||||||||
genus | Aurantimicrobium | 21 | 1 | ||||||||||||
genus | Aurantimonas | 33 | |||||||||||||
genus | Auraticoccus | 3 | 5 | 3 | |||||||||||
genus | Aureibacter | 13 | |||||||||||||
genus | Aureicoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Aureimonas | 8 | 30 | 1 | |||||||||||
genus | Aureispira | 1 | |||||||||||||
genus | Aureitalea | 1 | 3 | ||||||||||||
genus | Aureococcus | 1 | |||||||||||||
genus | Auricoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Auritidibacter | 16 | 1 | ||||||||||||
genus | Austwickia | 11 | 1 | ||||||||||||
genus | Auxenochlorella | 1 | |||||||||||||
genus | Avibacterium | 274 | 92 | 2 | 8 | 1 | 4 | ||||||||
genus | Azoarcus | 148 | 4 | 1 | 1 | 35 | 1 | ||||||||
genus | Azohydromonas | 10 | 2 | ||||||||||||
genus | Azomonas | 7 | |||||||||||||
genus | Azonexus | 21 | 1 | ||||||||||||
genus | Azorhizobium | 7 | 2 | 16 | |||||||||||
genus | Azorhizophilus | 7 | |||||||||||||
genus | Azospira | 15 | 7 | 9 | 1 | 31 | 1 | ||||||||
genus | Azospirillum | 475 | 408 | 1 | 13 | 2 | 35 | 4 | 4 | 2 | |||||
genus | Azotobacter | 4 | 28 | 1 | |||||||||||
genus | Babela | 6 | 2 | ||||||||||||
genus | Babesia | 1 | |||||||||||||
genus | Bacillus | 7 | 6 | 1 | 1 | ||||||||||
genus | Bacillus | 1713 | 676 | 66 | 11 | 28 | 1 | 27 | 35 | 35 | 8 | 6 | |||
genus | Bacteria | 1 | |||||||||||||
genus | Bacterioplanes | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Bacteriovorax | 10 | 80 | 1 | 12 | ||||||||||
genus | Bacteroides | 2450 | 1538 | 784 | 62 | 40 | 37 | 35 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
genus | Baekduia An et al. 2018 | 15 | |||||||||||||
genus | Baia | 94 | |||||||||||||
genus | Balneatrix | 34 | |||||||||||||
genus | Balneola | 91 | 382 | ||||||||||||
genus | Bariatricus | 3 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Barnesiella | 1181 | 414 | 15 | 14 | 14 | 4 | 35 | 34 | 16 | 2 | 2 | |||
genus | Barrientosiimonas | 33 | |||||||||||||
genus | Bartonella | 96 | 15 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
genus | Basfia | 8 | 1 | 5 | 1 | ||||||||||
genus | Basilea | 5 | 1 | ||||||||||||
genus | Bathycoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Bdellovibrio | 34 | 10 | 1 | 1 | 33 | 1 | 1 | |||||||
genus | Beauveria | 1 | |||||||||||||
genus | Beduini | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Beggiatoa | 3 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Beijerinckia | 5 | 3 | 1 | |||||||||||
genus | Belliella | 24 | 6 | 3 | |||||||||||
genus | Bellilinea | 7 | 1 | ||||||||||||
genus | Belnapia | 4 | 1 | ||||||||||||
genus | Bergeyella | 34 | 5 | 2 | |||||||||||
genus | Berkeleya | 1 | |||||||||||||
genus | Bermanella | 2 | |||||||||||||
genus | Bernardetia | 116 | 13 | 1 | |||||||||||
genus | Berryella Wylensek et al. 2020 | 1 | 3 | 35 | 1 | ||||||||||
genus | Besnoitia | 1 | |||||||||||||
genus | Beutenbergia | 7 | 1 | ||||||||||||
genus | Bhargavaea | 13 | |||||||||||||
genus | Bibersteinia | 4 | 1 | 8 | 1 | ||||||||||
genus | Bifidobacterium | 2417 | 1509 | 791 | 39 | 39 | 35 | 36 | 35 | 35 | 19 | 18 | 6 | 2 | 3 |
genus | Bigelowiella | 2 | 2 | ||||||||||||
genus | Bilophila | 2218 | 117 | 607 | 20 | 34 | 23 | 32 | 26 | 1 | 21 | 14 | 7 | 2 | 3 |
genus | Biomaibacter | 33 | 2 | ||||||||||||
genus | Biostraticola | 29 | |||||||||||||
genus | Bisgaardia | 121 | 1 | 9 | |||||||||||
genus | Bittarella | 3 | 8 | 8 | |||||||||||
genus | Bizionia | 2 | 2 | ||||||||||||
genus | Blastocatella | 1 | |||||||||||||
genus | Blastochloris | 9 | 24 | 1 | |||||||||||
genus | Blastococcus | 20 | 1 | 1 | 3 | 1 | |||||||||
genus | Blastocystis | 2 | 1 | ||||||||||||
genus | Blastomonas | 16 | 13 | 1 | |||||||||||
genus | Blastomyces | 1 | |||||||||||||
genus | Blastopirellula | 17 | |||||||||||||
genus | Blattabacterium | 1 | 32 | 4 | |||||||||||
genus | Blautia | 2450 | 1538 | 789 | 60 | 40 | 36 | 36 | 35 | 35 | 28 | 18 | 7 | 3 | 3 |
genus | Blochmannia | 600 | 2 | 11 | 4 | 6 | |||||||||
genus | Bogoriella | 12 | |||||||||||||
genus | Bombilactobacillus | 147 | 7 | ||||||||||||
genus | Bombiscardovia | 19 | 21 | ||||||||||||
genus | Bordetella | 53 | 1 | 35 | 4 | ||||||||||
genus | Borrelia | 22 | 2 | 19 | 4 | ||||||||||
genus | Borreliella | 8 | 11 | 4 | |||||||||||
genus | Bosea | 7 | 1 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
genus | Bosea | 8 | |||||||||||||
genus | Boseongicola | 2 | 12 | ||||||||||||
genus | Botrytis | 8 | 1 | ||||||||||||
genus | Boudabousia | 19 | |||||||||||||
genus | Bounagaea | 1 | |||||||||||||
genus | Bowdeniella | 27 | |||||||||||||
genus | Bowmanella | 72 | |||||||||||||
genus | Brachybacterium | 405 | 29 | 5 | 1 | 7 | 35 | 1 | |||||||
genus | Brachymonas | 4 | |||||||||||||
genus | Brachyspira | 25 | 13 | 1 | 35 | 4 | |||||||||
genus | Brackiella | 7 | |||||||||||||
genus | Bradymonas | 17 | 1 | ||||||||||||
genus | Bradyrhizobium | 66 | 2 | 10 | 1 | 35 | 4 | 1 | |||||||
genus | Brassicibacter | 1106 | 3 | 5 | 4 | ||||||||||
genus | Bremerella Rensink et al. 2020 | 3 | |||||||||||||
genus | Brenneria | 84 | 495 | 1 | 28 | 1 | 3 | ||||||||
genus | Breoghania | 12 | 1 | ||||||||||||
genus | Brevefilum | 14 | 1 | ||||||||||||
genus | Brevibacillus | 253 | 144 | 1 | 5 | 1 | 35 | 5 | 1 | ||||||
genus | Brevibacterium | 205 | 167 | 60 | 9 | 35 | 33 | 1 | 7 | ||||||
genus | Brevifollis | 32 | |||||||||||||
genus | Brevinema | 5 | 1 | ||||||||||||
genus | Brevirhabdus | 11 | 1 | ||||||||||||
genus | Brevundimonas | 56 | 48 | 7 | 1 | 2 | 35 | 4 | 3 | ||||||
genus | Breznakia | 8 | |||||||||||||
genus | Breznakibacter | 21 | 7 | ||||||||||||
genus | Brochothrix | 1462 | 78 | 1 | 1 | 23 | 1 | 1 | |||||||
genus | Brockia | 32 | |||||||||||||
genus | Brucella | 17 | 1 | 4 | 1 | 32 | 2 | ||||||||
genus | Bryobacter | 7 | |||||||||||||
genus | Bryocella | 1 | |||||||||||||
genus | Buchnera | 1 | 35 | 4 | |||||||||||
genus | Bulboplastis | 1 | |||||||||||||
genus | Bulleidia | 480 | 99 | 2 | 3 | 1 | 5 | ||||||||
genus | Burkholderia | 692 | 42 | 1 | 1 | 7 | 11 | 35 | 4 | 1 | 5 | ||||
genus | Buttiauxella | 174 | 10 | 1 | |||||||||||
genus | Butyribacter | 5 | 2 | 1 | 1 | ||||||||||
genus | Butyricicoccus | 923 | 77 | 10 | 13 | 33 | 34 | 34 | 24 | 1 | |||||
genus | Butyricimonas | 1886 | 1236 | 456 | 19 | 31 | 16 | 29 | 35 | 28 | 14 | 15 | 7 | ||
genus | Butyrivibrio | 1599 | 1497 | 418 | 25 | 10 | 29 | 28 | 35 | 34 | 1 | 3 | 7 | 3 | |
genus | Bythopirellula | 17 | |||||||||||||
genus | Caballeronia | 26 | 14 | 4 | |||||||||||
genus | Caedibacter | 4 | |||||||||||||
genus | Caenispirillum | 27 | |||||||||||||
genus | Caenorhabditis | 1 | |||||||||||||
genus | Caldalkalibacillus | 204 | 2 | 1 | |||||||||||
genus | Caldanaerobacter | 93 | 116 | 1 | 1 | 18 | 1 | ||||||||
genus | Caldanaerobius | 52 | 8 | ||||||||||||
genus | Caldanaerovirga | 5 | |||||||||||||
genus | Caldibacillus | 5 | 1 | 18 | 3 | ||||||||||
genus | Caldicellulosiruptor | 2261 | 115 | 4 | 32 | 1 | 35 | 5 | 6 | ||||||
genus | Caldicoprobacter | 54 | 119 | ||||||||||||
genus | Caldilinea | 789 | 10 | 14 | 3 | 7 | |||||||||
genus | Caldimicrobium | 3 | 1 | ||||||||||||
genus | Caldimonas | 29 | |||||||||||||
genus | Caldinitratiruptor | 411 | 7 | ||||||||||||
genus | Caldisalinibacter | 713 | 2 | ||||||||||||
genus | Caldisericum | 1 | 13 | 7 | 1 | ||||||||||
genus | Caldisphaera | 2 | |||||||||||||
genus | Calditerricola | 4 | |||||||||||||
genus | Calditerrivibrio | 14 | 1 | 3 | 1 | ||||||||||
genus | Caldithrix | 479 | 15 | 4 | 17 | 1 | 7 | ||||||||
genus | Callithamnion | 1 | |||||||||||||
genus | Calochaete | 16 | |||||||||||||
genus | Calonectria | 1 | |||||||||||||
genus | Caloramator | 2398 | 1077 | 1 | 9 | 24 | 2 | 9 | 35 | 1 | 7 | ||||
genus | Caloranaerobacter | 2 | 7 | 33 | |||||||||||
genus | Caloribacterium | 15 | |||||||||||||
genus | Calothrix | 1013 | 138 | 5 | 3 | 5 | 6 | ||||||||
genus | Camelimonas | 3 | |||||||||||||
genus | Caminibacter | 2 | 3 | 2 | 1 | ||||||||||
genus | Caminicella | 49 | 960 | 4 | |||||||||||
genus | Campylobacter | 915 | 560 | 263 | 28 | 12 | 3 | 7 | 35 | 34 | 7 | 7 | |||
genus | Candida | 9 | 27 | 1 | |||||||||||
genus | Candida | 9 | 9 | ||||||||||||
genus | Candidatus Azobacteroides | 137 | 14 | 4 | |||||||||||
genus | Candidatus Bipolaricaulis Hao et al. 2018 | 7 | |||||||||||||
genus | Candidatus Cytomitobacter Tashyreva, Prokopchuk, and Lukes 2018 | 4 | |||||||||||||
genus | Candidatus Desulforudis | 1 | 26 | ||||||||||||
genus | Candidatus Entotheonella Schmidt et al. 2000 | 5 | |||||||||||||
genus | Candidatus Fermentimicrarchaeum | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Forterrea | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Gloeomargarita Couradeau et al. 2012 | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Methanoregula Brauer et al. 2006 | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Methylomirabilis Ettwig et al. 2010 | 11 | |||||||||||||
genus | Candidatus Methylospira Danilova et al. 2016 | 13 | |||||||||||||
genus | Candidatus Nanopusillus | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Nitrosoglobus | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Nitrotoga Alawi et al. 2007 | 4 | |||||||||||||
genus | Candidatus Peribacter Anantharaman et al. 2016 | 7 | |||||||||||||
genus | Candidatus Prometheoarchaeum | 1 | |||||||||||||
genus | Candidatus Reidiella Russell et al. 2020 | 8 | |||||||||||||
genus | Candidatus Sumerlaea | 2 | |||||||||||||
genus | Candidatus Syntrophocurvum Sorokin et al. 2016 | 13 | |||||||||||||
genus | Candidatus Tenderia Eddie et al. 2016 | 1 | 25 | ||||||||||||
genus | Candidatus Tokpelaia Neuvonen et al. 2016 | 9 | |||||||||||||
genus | Candidatus Velamenicoccus Kizina et al. 2022 | 6 | 1 | ||||||||||||
genus | Candidatus Viadribacter Braun and Szewzyk 2016 | 4 | |||||||||||||
genus | Candidatus Walczuchella | 1 | |||||||||||||
genus | Candidimonas | 1 | |||||||||||||
genus | Canibacter | 2 | |||||||||||||
genus | Canicola | 115 | 5 | ||||||||||||
genus | Canis | 18 | |||||||||||||
genus | Capillimicrobium | 1 | |||||||||||||
genus | Capnocytophaga | 31 | 19 | 2 | 1 | 1 | 35 | 4 | 1 | ||||||
genus | Caproicibacter | 1 | |||||||||||||
genus | Caproicibacterium | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Caproiciproducens | 1 | 1 | 14 | 29 | 35 | 5 | ||||||||
genus | Carboxydocella | 1388 | 92 | 4 | 3 | 31 | 1 | 2 | |||||||
genus | Carboxydothermus | 52 | 2 | 4 | |||||||||||
genus | Carboxylicivirga | 344 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Cardinium | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Cardiobacterium | 59 | 141 | 2 | 1 | 18 | |||||||||
genus | Carnimonas | 29 | |||||||||||||
genus | Carnobacterium | 101 | 5 | 8 | 1 | 35 | 5 | 1 | 2 | ||||||
genus | Carsonella | 1 | |||||||||||||
genus | Carteria | 1 | |||||||||||||
genus | Casaltella | 1026 | 6 | 3 | |||||||||||
genus | Casimicrobium Song et al. 2020 | 16 | |||||||||||||
genus | Castellaniella | 16 | 1 | ||||||||||||
genus | Catabacter | 255 | 99 | 8 | 1 | 1 | 6 | ||||||||
genus | Catalinimonas | 1 | |||||||||||||
genus | Catellatispora | 3 | |||||||||||||
genus | Catellicoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Catenibacterium | 685 | 450 | 293 | 2 | 4 | 16 | 1 | 8 | 2 | |||||
genus | Catenisphaera | 121 | 2 | 1 | |||||||||||
genus | Catenovulum | 4 | 6 | 1 | |||||||||||
genus | Catenuliplanes | 1 | |||||||||||||
genus | Catenulispora | 8 | 13 | 4 | |||||||||||
genus | Catonella | 1679 | 1500 | 1 | 3 | 11 | 1 | 16 | 4 | ||||||
genus | Caulerpa | 1 | |||||||||||||
genus | Caulobacter | 21 | 18 | 1 | 1 | 35 | 4 | ||||||||
genus | Cavenderia | 1 | |||||||||||||
genus | Cecembia | 19 | |||||||||||||
genus | Cedecea | 108 | 5 | 34 | |||||||||||
genus | Celeribacter | 31 | 3 | ||||||||||||
genus | Celerinatantimonas | 6 | |||||||||||||
genus | Cellulomonas | 58 | 147 | 1 | 4 | 34 | 4 | ||||||||
genus | Cellulophaga | 4 | 2 | 19 | 4 | ||||||||||
genus | Cellulosibacter | 230 | |||||||||||||
genus | Cellulosilyticum | 1452 | 15 | 1 | 15 | 2 | 35 | 5 | |||||||
genus | Cellulosimicrobium | 4 | 25 | 2 | 1 | ||||||||||
genus | Cellvibrio | 43 | 50 | 1 | 32 | 3 | |||||||||
genus | Cenarchaeum DeLong and Preston 1996 | 3 | |||||||||||||
genus | Centipeda | 6 | |||||||||||||
genus | Cerasicoccus | 581 | 269 | 1 | 14 | 1 | |||||||||
genus | Cereibacter | 3 | 9 | 1 | 26 | 2 | |||||||||
genus | Cesiribacter | 52 | |||||||||||||
genus | Cetobacterium | 132 | 61 | 4 | 2 | 1 | |||||||||
genus | Chaetoceros | 1 | |||||||||||||
genus | Chamaesiphon | 5 | 3 | ||||||||||||
genus | Chania | 20 | 4 | 3 | |||||||||||
genus | Chattonella | 1 | |||||||||||||
genus | Chelativorans | 4 | 11 | 12 | 1 | ||||||||||
genus | Chelatococcus | 12 | 5 | 19 | 1 | ||||||||||
genus | Chelonobacter | 73 | 2 | 1 | |||||||||||
genus | Chiayiivirga | 4 | |||||||||||||
genus | chimpanzees | 1 | |||||||||||||
genus | Chishuiella | 6 | |||||||||||||
genus | Chitinibacter | 1 | |||||||||||||
genus | Chitinilyticum | 3 | |||||||||||||
genus | Chitinimonas | 25 | 1 | 10 | |||||||||||
genus | Chitinispirillum | 23 | 2 | ||||||||||||
genus | Chitinivibrio | 2 | |||||||||||||
genus | Chitinivorax | 12 | |||||||||||||
genus | Chitinolyticbacter | 1 | 8 | ||||||||||||
genus | Chitinophaga | 89 | 36 | 1 | 3 | 35 | 4 | ||||||||
genus | Chlamydia | 1 | 2 | 1 | 21 | 1 | |||||||||
genus | Chlamydomonas | 1 | |||||||||||||
genus | Chloracidobacterium | 20 | 9 | 3 | |||||||||||
genus | Chlorobaculum | 2018 | 7 | 1 | 25 | 34 | 4 | 2 | |||||||
genus | Chlorobium | 5 | 1 | 33 | 1 | ||||||||||
genus | Chloroflexus | 14 | 14 | 2 | |||||||||||
genus | Chlorogloeopsis | 19 | |||||||||||||
genus | Chloroherpeton | 14 | 30 | 6 | |||||||||||
genus | Chloroparvula | 1 | |||||||||||||
genus | Chloropicon | 1 | |||||||||||||
genus | Chlorosarcinopsis | 1 | |||||||||||||
genus | Chondrocystis | 1 | |||||||||||||
genus | Chondromyces | 101 | 1 | 1 | 19 | ||||||||||
genus | Chondrus | 1 | |||||||||||||
genus | Chordicoccus | 1 | |||||||||||||
genus | Christensenella | 380 | 180 | 3 | 15 | 28 | 16 | 35 | 5 | 2 | 2 | 7 | 1 | ||
genus | Chromatium | 477 | 7 | ||||||||||||
genus | Chromobacterium | 218 | 22 | 9 | 35 | 12 | 1 | ||||||||
genus | Chromocurvus Csotonyi et al. 2011 | 1 | |||||||||||||
genus | Chromohalobacter | 1 | 6 | 6 | 1 | ||||||||||
genus | Chroococcidiopsis | 5 | 1 | 27 | 1 | ||||||||||
genus | Chroococcus | 1012 | 2 | 2 | |||||||||||
genus | Chroothece | 1 | |||||||||||||
genus | Chryseobacterium | 172 | 45 | 2 | 1 | 35 | 4 | 1 | 6 | ||||||
genus | Chryseoglobus | 12 | |||||||||||||
genus | Chryseolinea | 52 | 27 | 4 | |||||||||||
genus | Chryseomicrobium | 34 | 2 | ||||||||||||
genus | Chrysochromulina | 1 | |||||||||||||
genus | Chthoniobacter | 41 | 12 | ||||||||||||
genus | Chthonomonas | 6 | 175 | 10 | 3 | ||||||||||
genus | Citreitalea | 4 | |||||||||||||
genus | Citricoccus | 9 | 2 | 16 | |||||||||||
genus | Citrifermentans | 4 | 13 | 2 | 5 | ||||||||||
genus | Citrobacter | 454 | 16 | 55 | 27 | 22 | 9 | 17 | 35 | 32 | 4 | 3 | 3 | ||
genus | Citromicrobium | 1 | 9 | 3 | |||||||||||
genus | Cladophialophora | 1 | |||||||||||||
genus | Clavibacter | 1 | 26 | 4 | |||||||||||
genus | Cloacibacillus | 219 | 183 | 106 | 2 | 4 | 3 | 32 | 1 | 1 | 1 | ||||
genus | Cloacibacterium | 18 | 2 | 1 | 10 | 3 | 1 | ||||||||
genus | Cloacimonas | 6 | 1 | ||||||||||||
genus | Clostridiisalibacter | 18 | |||||||||||||
genus | Clostridioides | 189 | 489 | 38 | 5 | 35 | 3 | 35 | 26 | 6 | 3 | ||||
genus | Clostridium | 2449 | 1531 | 779 | 56 | 40 | 37 | 35 | 35 | 35 | 1 | 17 | 7 | 3 | |
genus | Cnuella | 3 | |||||||||||||
genus | Cnuibacter | 3 | |||||||||||||
genus | Cobetia | 1 | 24 | 1 | |||||||||||
genus | Coccomyxa | 1 | |||||||||||||
genus | Cocleimonas | 2 | |||||||||||||
genus | Coenonia | 12 | |||||||||||||
genus | Cognaticolwellia Liu et al. 2020 | 1 | |||||||||||||
genus | Cohaesibacter | 1 | 10 | 1 | |||||||||||
genus | Cohnella | 776 | 81 | 3 | 3 | 35 | 5 | 7 | |||||||
genus | Coleofasciculus | 1 | |||||||||||||
genus | Colidextribacter | 1 | 14 | 23 | |||||||||||
genus | Colletotrichum | 1 | |||||||||||||
genus | Collimonas | 10 | 42 | 1 | 34 | 4 | |||||||||
genus | Collinsella | 1981 | 1325 | 772 | 31 | 22 | 25 | 32 | 35 | 35 | 14 | 7 | 3 | ||
genus | Colwellia | 2 | 66 | 1 | 23 | 4 | |||||||||
genus | Comamonas | 215 | 47 | 22 | 1 | 35 | 3 | 8 | 1 | ||||||
genus | Commensalibacter | 3 | |||||||||||||
genus | Companilactobacillus | 279 | 206 | 1 | 1 | 1 | 35 | 5 | |||||||
genus | Conchiformibius | 8 | 5 | 6 | |||||||||||
genus | Conexibacter | 10 | 8 | 16 | |||||||||||
genus | Confluentimicrobium | 1 | |||||||||||||
genus | Congregibacter | 8 | |||||||||||||
genus | Coniophora | 1 | |||||||||||||
genus | Constrictibacter | 2 | 1 | ||||||||||||
genus | Contubernalis | 327 | 5 | ||||||||||||
genus | Coprobacillus | 2383 | 778 | 155 | 9 | 26 | 29 | 5 | 8 | 2 | 3 | 7 | |||
genus | Coprobacter | 848 | 337 | 2 | 5 | 9 | 9 | 3 | 1 | ||||||
genus | Coprococcus | 2444 | 1537 | 2 | 26 | 40 | 36 | 31 | 35 | 31 | 2 | 17 | 7 | 3 | |
genus | Coprophilus | 3 | |||||||||||||
genus | Coprothermobacter | 24 | 98 | 7 | 1 | ||||||||||
genus | Coraliomargarita | 696 | 121 | 12 | 1 | ||||||||||
genus | Corallibacter | 1 | |||||||||||||
genus | Corallococcus | 1 | 33 | 4 | |||||||||||
genus | Cordyceps | 1 | |||||||||||||
genus | Coriobacterium | 189 | 61 | 1 | 2 | 35 | 3 | ||||||||
genus | Corticibacter | 5 | |||||||||||||
genus | Corynebacterium | 1215 | 869 | 444 | 22 | 25 | 13 | 8 | 35 | 34 | 7 | 1 | |||
genus | Costertonia | 1 | |||||||||||||
genus | Couchioplanes | 6 | 21 | ||||||||||||
genus | Coxiella | 31 | 1 | 1 | |||||||||||
genus | Coxiella | 1 | |||||||||||||
genus | Crassaminicella | 1 | 35 | 1 | |||||||||||
genus | Crateriforma Peeters et al. 2020 | 2 | |||||||||||||
genus | Craurococcus | 2 | |||||||||||||
genus | Crenobacter | 11 | |||||||||||||
genus | Crenothrix | 4 | |||||||||||||
genus | Criblamydia | 45 | |||||||||||||
genus | Criibacterium | 1 | |||||||||||||
genus | Crinalium | 1 | 1 | ||||||||||||
genus | Crithidia | 1 | |||||||||||||
genus | Croceibacter | 11 | 1 | ||||||||||||
genus | Croceibacterium | 7 | 1 | ||||||||||||
genus | Croceicoccus | 17 | 1 | ||||||||||||
genus | Cronobacter | 84 | 83 | 6 | 1 | 34 | 6 | ||||||||
genus | Cruoricaptor | 79 | 1 | ||||||||||||
genus | Cryobacterium | 3 | 3 | 11 | 31 | 1 | |||||||||
genus | Cryomorpha | 137 | |||||||||||||
genus | Cryptanaerobacter | 12 | 5 | ||||||||||||
genus | Cryptobacterium | 616 | 1 | 1 | 3 | 29 | 1 | ||||||||
genus | Cryptococcus | 13 | |||||||||||||
genus | Cryptosporangium | 3 | |||||||||||||
genus | Cryptosporidium | 5 | |||||||||||||
genus | Cucumibacter | 2 | |||||||||||||
genus | Cucurbitaria | 1 | |||||||||||||
genus | Culturomica | 13 | |||||||||||||
genus | Cuneatibacter | 15 | |||||||||||||
genus | Cupidesulfovibrio | 3 | 17 | ||||||||||||
genus | Cupriavidus | 18 | 66 | 1 | 1 | 1 | 35 | 4 | |||||||
genus | Curtobacterium | 23 | 1 | 1 | 29 | 1 | |||||||||
genus | Curvibacter | 53 | 7 | 6 | 1 | 20 | 2 | ||||||||
genus | Cutaneotrichosporon | 1 | |||||||||||||
genus | Cutibacterium | 7 | 14 | 29 | 1 | 35 | 3 | 1 | |||||||
genus | Cyanobacterium | 372 | 47 | 16 | 1 | ||||||||||
genus | Cyanobium | 7 | 1 | 1 | 30 | 1 | |||||||||
genus | Cyanophora | 1 | |||||||||||||
genus | Cyanoptyche | 1 | |||||||||||||
genus | Cyanothece | 7 | 1 | ||||||||||||
genus | Cyberlindnera |